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篮子鱼属线粒体基因组序列系统发育信息分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄小林 1 ; 杨育凯 1 ; 林黑着 1 ; 李涛 1 ; 虞为 1 ; 黄忠 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院南海水产研究所深圳试验基地;中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源开发利用重点实验室

关键词： 篮子鱼属;线粒体;系统发育;分子标记

期刊名称： 生物学杂志

ISSN： 2095-1736

年卷期： 2018 年 35 卷 05 期

页码： 33-36

收录情况： CSCD

摘要： 分析了6条篮子鱼的mtDNA全序列,揭示了篮子鱼mtDNA的基本结构、变异位点、基因选择压力及系统进化等信息。结果表明:1)篮子鱼mtDNA由37个基因组成,其中ND3基因的变异位点比例最高(22. 77%),比例最小为12S rRNA(4. 01%); 2) mtDNA蛋白编码基因(13个)的Ka/Ks均远小于1,且Tajima's D=0. 123 74~0. 615 14(P> 0. 10)均不显著大于或小于0,表明篮子鱼mtDNA蛋白编码基因进化过程中均受到的稳定性(负)选择作用较强; 3)系统进化分析表明,尖嘴篮子鱼与狐篮子鱼最先聚成一支,再依次与眼带篮子鱼和点篮子鱼聚类,之后与褐篮子鱼和长鳍篮子鱼聚成的一支聚类,这种进化顺序与各篮子鱼体色变化一致; 4) COX1、ND4和Cytb基因是篮子鱼属内种间系统进化的理想分子标记。

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