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玉米磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王重 1 ; 樊哲儒 1 ; 张跃强 1 ; 李剑峰 1 ; 高新 1 ;

作者机构： 1.新疆农业科学院核技术生物技术研究所

关键词： C4植物;光合作用效率;PEPC;生物信息学分析

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2016 年 44 卷 20 期

页码： 114-117

摘要： [目的]获得玉米的PEPC基因,并对其生物信息学进行分析。[方法]使用RT-PCR方法由玉米中获得PEPC全长c DNA,构建克隆载体后进行测序,并对其序列进行生物信息学分析。[结果]获得的玉米PEPC基因CDS全长2 913 bp,编码的多肽链包含970个氨基酸,为疏水性氨基酸,由α-螺旋(61.44%)、无规则卷曲(34.43%)和延伸链(4.12%)组成,定位于细胞质,不存在跨膜结构域,其175~970位氨基酸组成了磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的功能结构域,在173~184、597~609位具有2个磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶活性位点。[结论]该研究克隆了玉米C_4型丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)基因,它所编码的氨基酸序列具备PPDK蛋白的保守序列和催化活性中心区域。

  • 相关文献

[1]玉米高光效基因ppdk的克隆及其生物信息学分析. 王重,张跃强,樊哲儒,李剑峰,赵奇,王子霞,海热古丽·阿不力孜,张宏芝. 2010

[2]8个新疆扁桃S-基因多态性与生物信息学研究. 郭春苗,杨波,吐迪·麦麦提,李宁,唐亚萍,龚鹏,王继勋. 2016

[3]大麦SRO家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 李志强,聂石辉,王仙,向莉,刘恩良,方伏荣. 2022

[4]21种植物八氢番茄红素合成酶的生物信息学分析. 李宁,王柏柯,杨生保,唐亚萍,王强,杨涛,帕提古丽,余庆辉. 2015

[5]枣PAO基因的鉴定及在果实发育和贮藏过程中的表达分析. 李丽莉,樊丁宇,杨磊,靳娟,郝庆. 2023

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