您好,欢迎访问新疆农垦科学院 机构知识库!

细粒棘球绦虫TSP2基因的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王宁 1 ; 赵鹏鹏 1 ; 张艳艳 2 ; 马勋 1 ; 王正荣 2 ; 薄新文 2 ;

作者机构: 1.石河子大学动物科技学院

2.省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室/新疆农垦科学院畜牧兽医研究所

关键词: 细粒棘球绦虫;TSP2;生物信息学分析;qRT-PCR

期刊名称: 中国病原生物学杂志

ISSN:

年卷期: 2021 年 008 期

页码: 916-921

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的克隆细粒棘球绦虫发育相关基因Tetraspain 2-TSP2(TSP2),并对其进行生物学分析。方法通过在线检索WormBas ParaSite网站中Eg细粒棘球绦虫基因组数据库,获得TSP1的cDNA序列并设计特异性引物。提取细粒棘球绦虫原头蚴总RNA,以此模板,RT-PCR扩增TSP2基因,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后进行测序,并进行生物信息学分析。通过SYBR Green I qRT-PCR方法分析TSP2基因在原头蚴、包囊壁以及成虫中mRNA的相对表达量。结果克隆的TSP2基因序列与WormBas ParaSite中已登录的细粒棘球绦虫跨膜蛋白EGR05083.1同源性为100%。TSP2基因cDNA全长621个核苷酸,编码206个氨基酸的TSP2蛋白,理论等电点为7.33,不稳定指数为47.50,为不稳定蛋白。脂肪系数为109.71,亲水性疏水性平均值为0.987,为疏水性可溶性蛋白。TSP2编码的蛋白含有4个跨膜区,4个优势B抗原表位,属于跨膜蛋白家族,该蛋白具有3个开放阅读框。qRT-PCR显示,TSP2基因在细粒棘球绦虫原头蚴、包囊壁及成虫中均有转录,转录水平差异无统计学意义(P>0.05)。结论细粒棘球绦虫TSP2基因其编码蛋白含有优势B抗原表位,为包虫病重组免疫诊断抗原和亚单位疫苗的研发奠定了基础。

  • 相关文献

[1]细粒棘球绦虫3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因的克隆及在其不同阶段的差异表达和生物信息学分析. 县锦雯,王炜烨,王芸菲,陆宝燕,张艳艳,孟季蒙,王正荣,薄新文. 2020

[2]细粒棘球绦虫锌指蛋白基因的克隆、序列分析及在不同发育阶段的表达分析. 徐梦飞,卢平萍,马勋,张艳艳,王炜烨,孟季蒙,王正荣,薄新文. 2018

[3]细粒棘球绦虫乳酸脱氢酶基因的生物信息学分析及原核表达. 赵文卿,薄新文,普娜,张玉霞,陈旭珂,张艳艳,孙艳,齐萌,王正荣. 2024

[4]细粒棘球绦虫EGR-07243和EGR-07244基因生物信息学分析及原核表达. 贾新月,马静,张艳艳,马勋,王正荣,薄新文. 2023

[5]细粒棘球绦虫CD151蛋白的生物信息学分析及其编码基因在不同发育阶段的表达. 赵鹏鹏,县锦雯,王宁,马勋,张艳艳,孟季蒙,王正荣,薄新文. 2021

[6]石河子部分地区家犬细粒棘球绦虫感染情况调查. 王伟,陈桂香,张艳艳,王正荣. 2015

[7]6个wnt基因家族基因在细粒棘球绦虫原头节和成虫的差异表达分析. 王正荣,张艳艳,薄新文,徐雪平,徐春生. 2016

[8]基于cox2基因的细粒棘球绦虫环介导等温扩增检测方法的初步建立. 张艳艳,叶倩,王正荣,薄新文. 2017

[9]细粒棘球绦虫脂肪酸去饱和酶1基因序列及不同发育阶段表达分析. 徐梦飞,卢平萍,马勋,张艳艳,王炜烨,孟季蒙,王正荣,薄新文. 2019

[10]细粒棘球绦虫原头蚴lncRNA表达谱分析. 王正荣,张艳艳,马勋,刘乙,徐梦飞,孟季蒙,薄新文. 2019

[11]石河子地区绵羊细粒棘球绦虫分离株的基因型研究. 王志胜,陈桂香,张艳艳,王正荣. 2017

[12]Th1/Th2型免疫反应相关基因在巨噬细胞RAW264.7应对细粒棘球绦虫原头蚴刺激时的表达谱研究. 王正荣,马勋,张艳艳,孟季蒙,薄新文. 2022

[13]细粒棘球绦虫nanos基因的分子克隆及序列分析. 叶倩,马勋,薄新文,王正荣,张艳艳. 2015

[14]细粒棘球绦虫原头蚴蛋白表达谱分析. 王正荣,薄新文,张艳艳,马勋,王智欣,卢平萍. 2017

[15]细粒棘球绦虫原头蚴microRNA表达谱分析. 王正荣,薄新文,张艳艳,马勋,卢平萍,徐梦飞,孟季蒙. 2018

[16]转录组测序分析细粒棘球绦虫原头蚴刺激后巨噬细胞Raw264.7 IncRNA表达的研究. 王正荣,马勋,张艳艳,刘乙,孟季蒙,薄新文. 2021

[17]细粒棘球绦虫原头蚴对小鼠巨噬细胞RAW264.7一氧化氮分泌的影响. 卢平萍,王正荣,张艳艳,王智欣,马勋,薄新文. 2017

[18]细粒棘球绦虫原头蚴microRNA表达谱分析. 王正荣,薄新文,张艳艳,马勋,卢平萍,徐梦飞,孟季蒙. 2018

[19]细粒棘球绦虫EGR-03347基因的原核表达及其对小鼠免疫效果的初步研究. 县锦雯,王炜烨,王芸菲,张艳艳,马勋,孟季蒙,王正荣,薄新文. 2021

[20]细粒棘球绦虫蛋白质组学研究进展. 徐梦飞,卢平萍,马勋,张艳艳,王炜烨,孟季蒙,王正荣,薄新文. 2018

作者其他论文 更多>>