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中国近海黑鲷线粒体DNA控制区序列多态性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 龚金波 1 ; 苏天凤 2 ; 夏军红 2 ; 龚世园 1 ; 江世贵 2 ;

作者机构： 1.华中农业大学水产学院

2.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词： 黑鲷;DNA序列;线粒体控制区;多态性

期刊名称： 南方水产

ISSN： 1673-2227

年卷期： 2006 年 2 卷 04 期

页码： 24-30

摘要： 采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法,测定了广西北海、广东深圳和山东青岛3个地理群体共72尾黑鲷(Acanthopagrusschlegeli)线粒体Dloop第一高变区5′端547～549bp序列,以探讨黑鲷种群的遗传变异。分析结果表明:72条序列T、C、A、G4种核苷酸的平均含量分别为30.8%、21.8%、36.3%、11.0%。共检测到55个变异位点,其中转换位点32个,颠换位点19个,缺失/颠换位点1个,插入/颠换位点3个。72个个体具有51种单倍型(haplotype),单倍型比率为70.8%,黑鲷线粒体Dloop控制区表现出较为丰富的核苷酸多态性。对其所有单倍型依据序列距离使用NJ法构建的亲缘关系树并无明显的系谱分支,没有显示出明显的地理分布族群,说明黑鲷线粒体DNA控制区第一高变区序列无法用于黑鲷种群的鉴别。

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