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中国大菱鲆虹彩病毒主要衣壳蛋白基因的PCR扩增及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 史成银 1 ; 王印庚 1 ; 黄倢 1 ; 王清印 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室

关键词： 大菱鲆;虹彩病毒;主要衣壳蛋白基因;聚合酶链反应;序列分析

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2005 年 12 卷 05 期

页码： 588-593

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用同源PCR技术,从被一种球状病毒感染的患病大菱鲆(Scophthalmus maximus)脾脏和肾脏组织中扩增出了一段长度为620 bp的DNA片断。序列测定和Blast分析表明,该DNA片断与鱼类虹彩病毒主要衣壳蛋白(MCP)C末端编码区的DNA序列高度相似,由此证实感染养殖大菱鲆的这种球状病毒为一种鱼类虹彩病毒,暂命名为大菱鲆红体病虹彩病毒(TRBIV)。多序列比对和分析发现,TRBIV MCP C末端的205个氨基酸序列与GenBank中20种虹彩病毒相应序列的相似性分别为99.47%(韩国大菱鲆虹彩病毒)、97%~98%(待指定病毒属的7种病毒),以及50%以下(蛙病毒属、淋巴囊肿病毒属、虹彩病毒属的12种病毒),由此绘制出了包含TRBIV在内的21种虹彩病毒的系统发育树。研究结果表明,感染中国养殖大菱鲆的TRBIV属于虹彩病毒科待指定病毒属,位于该属ISKNV亚群和RSIV亚群之间,是该病毒属的一个新成员。

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