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用LA-PCR方法克隆东方田鼠部分Y染色体序列

文献类型: 中文期刊

作者: 姜宪环 1 ; 蔡慧强 1 ; 高骏 2 ; 倪丽菊 3 ; 李凯 1 ; 肖君华 1 ; 周宇荀 1 ;

作者机构: 1.东华大学化学化工与生物工程学院

2.上海市农业科学院

3.上海实验动物研究中心

关键词: 东方田鼠;单核苷酸多态性位点;Y染色体保守性靶标位点;长片段PCR;Microtusfortis; Single nuclear polymorphism (SNP); Y chromosome conserved anchored tagged sequences (YCATS); Long and accurate polymerase chain reaction (LA-PCR)

期刊名称: 实验动物与比较医学

ISSN: 1674-5817

年卷期: 2012 年 32 卷 004 期

页码: 324-328

摘要: 目的 克隆东方田鼠长江亚种(Microtus fortis calamorum)和宁夏指名亚种(Microtus fortis fortis)Y染色体的部分序列,并挖掘这两个亚种间的单核苷酸多态性位点(SNPs).方法 本研究利用依据Y染色体保守性靶标位点(YCATS)设计的引物,测得Y染色体上的8个内含子短片段序列,进而设计长片段PCR(LA-PCR)引物来获得相距几kb的两个内含子之间的长片段序列.结果 获得东方田鼠长江亚种和宁夏指名亚种Y染色体上的7300 bp序列,比对这两个亚种的序列后发现4个SNPs位点.结论 获得了田鼠Y染色体上的7 300 bp序列和4个SNPs位点.

  • 相关文献

[1]中国6个地区东方田鼠线粒体全基因组的比较与多态性位点的发掘. 高骏,倪丽菊,孙凤萍,肖君华,周宇荀,李凯. 2017

[2]基于微卫星位点的中国4个野生东方田鼠群体的遗传多样性分析. 高骏,倪丽菊,孙凤萍,肖君华,周宇荀,李凯. 2016

[3]东方田鼠部分BAC文库的微卫星筛选. 汤敏,倪丽菊,高骏,肖君华,胡建华,高诚. 2012

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