文献类型: 中文期刊
作者: 郭震华 1 ; 蔡丽君 2 ; 潘国君 1 ; 王立楠 1 ; 周雪松 1 ; 杜晓东 1 ; 蔡永盛 1 ; 张希瑞 1 ; 韩笑 1 ; 周通 1 ; 马文东 1 ;
作者机构: 1.黑龙江省农业科学院牡丹江分院水稻研究所
2.黑龙江省农业科学院佳木斯分院
关键词: 寒地水稻;孕穗期;低温;转录组;植物激素
期刊名称: 种子
ISSN: 1001-4705
年卷期: 2024 年 008 期
页码: 60-68,78
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为深入了解寒地水稻孕穗期耐低温机理,明确低温应答的分子机制,本研究对孕穗期耐冷性强的水稻品种龙粳25(LG25)的幼穗进行低温胁迫转录组动态分析。通过测序,共获得515.26 Mb的Clean Reads,筛选获得6 927个差异表达基因(DEGs)。其中,低温处理2 d时,获得6 784个DEGs;低温处理4 d后,DEGs显著减少,仅获得1 149个。GO富集分析表明,韦恩图各部分的上调和下调基因分别显著富集到33个生物进程GO类别,其中包含基因数最多的类别为单生物代谢过程,低温应答和高温应答在LG25的韦恩图各部分富集最多。KEGG富集分析表明,韦恩图各部分DEGs共富集到32条信号通路,其中植物激素信号转导通路在韦恩图各部分显著富集最多,共包含83个DEGs,分布在脱落酸、生长素、油菜素内酯、细胞分裂素、赤霉素、乙烯、茉莉酸、水杨酸等8个激素通路中,以生长素、脱落酸和水杨酸等激素包含的DEGs较多,分别为26个、17个和15个。
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