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南方水稻黑条矮缩病毒的检测及遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陆文静 1 ; 周通 1 ; 韩笑 1 ; 周雪松 1 ; 宋成艳 1 ; 刘乃生 1 ; 郭震华 1 ; 王翠 1 ; 王桂玲 1 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院牡丹江分院水稻研究所

关键词: 水稻;分子检测;RT-PCR;CP;遗传多样性

期刊名称: 东北农业大学学报

ISSN: 1005-9369

年卷期: 2025 年 56 卷 002 期

页码: 1-9

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确南方水稻黑条矮缩病在海南省发生情况及其病原——南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)变异情况,采用RT-PCR方法对海南省5个地区表现为矮缩和叶色浓绿症状的154份水稻样品进行检测。结果表明:SRBSDV平均检出率为50.12%。对其中7份样品的SRBSDV外壳蛋白(Coat protein,CP)基因序列进行克隆和遗传多样性分析,7条CP序列核苷酸和编码蛋白氨基酸序列一致性分别为99.51%~99.82%和99.23%~99.72%,与NCBI数据库中获取的其他15条SRBSDV分离物的CP基因核苷酸和氨基酸序列一致性分别为97.82%~99.83%和97.50%~99.21%。构建系统发育进化树发现,SRBSDV CP基因序列与来自中国(中国的江苏),(登录号:HQ916872)和越南(登录号:KM454846)序列聚为一簇,亲缘关系较近。遗传距离分析显示,7条序列与中国(中国的江西)分离物(登录号:JQ927009)的遗传距离为0.002~0.005,差异不显著。

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