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谷子SiSAP8基因的克隆及dCAPS标记开发

文献类型： 中文期刊

作者： 王亦学 1 ; 郝曜山 1 ; 张欢欢 1 ; 董艳辉 1 ; 王晓清 1 ; 孙毅 1 ;

作者机构： 1.山西省农业科学院生物技术研究中心

关键词： 谷子(Setaria italica);SiSAP8;多态性;dCAPS标记开发

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 015 期

页码： 4997-5002

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 谷子是中国北方重要的耐旱杂粮作物.胁迫相关蛋白是一类具有A20和(或) AN1结构域的锌指蛋白,广泛参与植物对非生物胁迫的响应.本研究从'晋谷20'中克隆得到谷子SiSAP8基因,该基因编码区513 bp,编码170个氨基酸,分子量为18.20 kD,等电点为8.28,包含1个A20和1个AN1结构域.在对该基因序列进行多态性分析,共发现5个SNP位点和1个InDel,其中编码区有1处核苷酸变异位点(G/T)为非同义突变,使得缬氨酸变成了苯丙氨酸.利用第81位的SNP位点(A/G)开发了dCAPS标记,命名为'SNP-81',该标记的开发为后期功能鉴定及关联分析提供了依据.

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