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高温胁迫下不同玉米花粉组蛋白Zm-H3基因的克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 徐劲松 1 ; 杨海鹏 1 ; 张红梅 1 ; 刘小红 2 ; 郝耀山 3 ; 孙毅 3 ;

作者机构: 1.山西省农业科学院玉米研究所

2.西华师范大学生命科学学院

3.山西省农业科学院生物技术研究中心

关键词: 玉米;组蛋白;转录组;生物信息学;基因表达

期刊名称: 种子

ISSN:

年卷期: 2021 年 001 期

页码: 11-16

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解组蛋白H 3基因(Zm-H3)在不同耐高温玉米(Zea mays L.)材料中的差异表达情况,以中地88(耐高温)和先玉335(不耐高温)2个玉米品种为材料,在高温条件下取其花粉提取总RNA,再通过mRNA纯化、反转录、文库构建及高通量测序等步骤,克隆了一个玉米组蛋白Zm-H3。生物信息学分析表明,该基因位于玉米第6染色体上,全长cDNA为904 bp,编码长度为136个氨基酸的蛋白质,进一步对该蛋白的理化性质、功能位点及结构作了分析。转录组高通量测序结果显示,Zm-H3基因在这2个玉米材料中的表达呈现显著差异,在中地88材料中出现了高表达,为先玉335材料的2.08倍。该实验结果可以为玉米组蛋白H 3基因的应用研究奠定分子基础,也可为其它基因的克隆及表达分析提供参考。

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