您好，欢迎访问山西省农业科学院 机构知识库！
山西省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

高温胁迫下不同玉米材料间的基因差异表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 曹丹 1 ; 张红梅 2 ; 杨海鹏 2 ; 赵欢 1 ; 刘小红 1 ;

作者机构： 1.西华师范大学生命科学学院

2.山西省农业科学院玉米研究所

关键词： 玉米;转录组;高温胁迫;差异表达

期刊名称： 甘肃农业大学学报

ISSN： 1003-4315

年卷期： 2021 年 56 卷 001 期

页码： 42-49

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]认识高温胁迫条件下不同玉米材料间的基因差异表达,为阐明玉米耐高温胁迫的分子遗传机制提供理论基础.[方法]以耐高温胁迫的中地88和高温敏感的先玉335两个玉米品种为试验材料,在42℃高温条件下取其花粉提取总RNA,再经mRNA纯化、反转录、文库构建及转录组测序等一系列过程,对其基因差异表达作生物信息学分析.[结果]共发现基因24553个,以先玉335为对照,上调表达基因857个,下调表达基因965个,无显著差异表达基因22731个,这些基因较均一地分布于玉米的10条染色体.对差异表达基因进行GO富集分析,结果显示:与细胞组分、分子功能及生物过程相关的GO条目数分别为491、1062和2320个;在GO注释的差异表达基因中,进一步分析发现直接应答于热激效应的基因有7个,其中2个上调表达,5个下调表达;与热激蛋白结合有关的基因有3个,其中1个上调表达,2个下调表达.对差异表达基因作KEGG富集分析发现有102个小通路,这些小通路可进一步归为6个大通路,包括细胞过程3个、环境信息处理4个、遗传信息处理20个、人类疾病1个、新陈代谢72个和有机系统2个.[结论]转录组测序是在基因组水平认识基因差异表达的有效方法,共发现12个与玉米耐高温胁迫相关的差异表达基因.

  • 相关文献

[1]玉米cDNA-SRAP反应体系的优化. 苏亮,白建荣,王秀红. 2010

[2]玉米半乳糖代谢相关酶蛋白基因的克隆及表达. 杨海鹏,曹丹,刘小红,陈伟,张红梅,刘娅娟. 2021

[3]高温胁迫对玉米光合作用的影响. 郭文建,刘海. 2014

[4]高温胁迫下不同玉米花粉组蛋白Zm-H3基因的克隆及表达分析. 徐劲松,杨海鹏,张红梅,刘小红,郝耀山,孙毅. 2021

[5]干旱和盐胁迫条件下枣树谷胱甘肽过氧化物酶基因(ZjGPX)的差异表达及功能分析. 肖蓉. 2016

[6]利用转录组测序方法研究獭兔毛色相关基因. 牛晓艳,任克良,曹亮,李燕平,郑建婷,冯国亮,黄淑芳. 2016

[7]干旱和盐胁迫条件下枣树谷胱甘肽过氧化物酶基因(ZjGPX)的差异表达及功能分析. 肖蓉,罗慧珍,张小娟,邓舒,张春芬,任莹,孟玉平,曹秋芬,聂园军. 2015

[8]抑制差减杂交法(SSH)及其在植物中的应用. 孙常青,施俊凤,郭志利,刘烨锋. 2007

[9]中华蜜蜂PLA2基因的生物信息学分析及响应高温胁迫的表达模式. 李新宇,马卫华,李立新,申晋山,杜亚丽,龙登隆,张琪,刘晋佳,王春梅,兰俊,冯宇佳,姜玉锁. 2020

[10]高温胁迫对观赏凤梨叶片抗氧化系统和渗透调节物质积累的影响. 段九菊,王云山,康黎芳,张超,王曼,杜少敏,曹冬梅. 2010

[11]外源茉莉酸对高温胁迫下的红掌幼苗的影响. 韩忻彦,王云山,张超,康黎芳,曹冬梅. 2009

[12]多年生黑麦草高温半致死温度与耐热性研究. 石永红,万里强,刘建宁,王运琦,吴欣明,李向林. 2010

[13]高温胁迫下甜菜硷和甘露醇对仙客来的保护效应. 曲复宁,尤翠荣,康黎芳,李立新,王云山. 2002

[14]基于RNA-Seq技术的谷子新基因发掘及基因结构优化. 穆彩琴,张瑞娟,屈聪玲,韩渊怀,王兴春. 2016

[15]拟南芥不定芽发生早期的数字基因表达谱分析. 王兴春,杨致荣,张树伟,李红英,李生才. 2013

[16]辣椒苗期抗感疫病比较转录组学分析. 雷阳,成妍,乔宁,焦彦生,苗如意,杨玉花. 2019

[17]银杏MYB转录因子的鉴定及特征分析. 石晓雯,孙岩,丁娜,孙惠英,王婷,贾小云,李润植. 2017

[18]大白菜花发育不同时期的转录组研究. 李改珍,齐仙惠,李梅兰,赵军良,王秀英,巫东堂. 2017

[19]白羊草转录组和差异性表达分析. 方志红,石永红,吴欣明,任彬琳,张燕,贾会丽,郭璞,池惠武,李莲芬,王运琦,董宽虎,刘建宁. 2018

[20]不同灌溉水量下不同玉米品种水分利用率及相关原因分析. 樊修武,池宝亮,黄学芳,张健. 2008

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：山西省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台