您好，欢迎访问广东省农业科学院 机构知识库！
广东省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

柑橘GAST1基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张永艳 1 ; 郝向阳 2 ; 钟云 2 ; 程春振 3 ;

作者机构： 1.福建农林大学园艺学院;广东省农业科学院果树研究所

2.;福建农林大学园艺学院;广东省农业科学院果树研究所

3.;福建农林大学园艺学院;广东省农业科学院果树研究所;

关键词： GAST1基因;基因克隆;生物信息学分析;GASA结构域;半胱氨酸

期刊名称： 园艺与种苗

ISSN： 2095-0896

年卷期： 2017 年 05 期

页码： 17-21

摘要： [目的]克隆一个受CTV(CitrusTristezaVirus,柑橘速衰病毒)诱导的GAST1基因,通过生物信息学分析手段揭示其可能的作用方式。[方法]以克里曼丁橘cDNA为材料,通过扩增获得该基因,并利用生物信息学软件进行分析。[结果]该基因编码序列(CDS)长度为357bp,预测可编码含有118个氨基酸残基的蛋白质,其中半胱氨酸、脯氨酸和丝氨酸含量较高,分别占总蛋白的10.2%、8.5%和8.5%。生物信息学分析结果显示,CcGAST1编码的蛋白为具有信号肽的亲水性蛋白,具有GAST家族蛋白所特有的GASA结构域。多重序列比对结果显示和其他物种GAST1蛋白一样,CcGAST1蛋白C端非常保守,含有12个保守的半胱氨酸。以不同植物GAST1蛋白序列构建进化树,发现克里曼丁橘与甜橙亲缘关系最近,其次是核桃。[结论]CcGAST1富含半胱氨酸和脯氨酸残基,其保守的GASA结构域和12个保守的半胱氨酸残基可能与其功能相关。

  • 相关文献

[1]木薯赤霉素途径DELLA蛋白基因克隆及其对干旱胁迫的响应. 廖文彬,彭明. 2012

[2]荔枝蒂蛀虫海藻糖酶基因克隆及生物信息学分析. 姚琼,梁展图,段双刚,董易之,徐淑,李文景. 2024

[3]1型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR全长基因的扩增及生物信息学分析. 袁建丰,覃宗华,吕敏娜,李林林,孙敏华,董嘉丈,胡奇林. 2011

[4]Ⅰ型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR基因的发现及生物信息学分析. 袁建丰,覃宗华,吕敏娜,吴彩艳,余劲术,孙铭飞,蔡建平. 2009

[5]1型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR全长基因的扩增及生物信息学分析. 袁建丰,覃宗华,蔡建平,谢明权. 2011

[6]茄子AP2/ERF转录因子的鉴定及胁迫条件下的表达分析. 邵欣欣,李涛,李植良,宇丽,黎振兴. 2015

[7]鸭坦布苏病毒贵州株分离鉴定及其E基因生物信息学分析. 徐景峨,胡成云,陈汝佳,李婷,张亚楠,余波,张雨梅,李林林. 2023

[8]副猪嗜血杆菌sapA基因克隆与生物信息学分析. 郭海祥,李艳,郭怡德,宋帅,勾红潮,臧莹安,李春玲. 2021

[9]香蕉GAPDH基因家族的生物信息学及转录表达分析. 史后蕊,冯仁军,王静毅,柴娟,任梦云,卢利方,张银东. 2014

[10]马铃薯GA2ox家族基因响应赤霉素(GA)和低温胁迫表达分析. 刘计涛,王梦诗,索海翠,王丽,单建伟,李成晨,安康,李小波. 2023

[11]香蕉高亲和性钾转运蛋白(HAK)家族全基因组鉴定及表达. 田娜,王斌,伍俊为,武欢,刘嘉鹏,刘范,邓贵明,黄玉吉,程春振. 2022

[12]水稻WOX家族基因鉴定及其种子在逆境萌发中的表达分析. 张琪,张爱霞,贾俊婷,赵华,刘军,陈兵先. 2022

[13]辣椒组蛋白去乙酰化基因家族分离鉴定及表达分析. 李涛,徐小万,黎振兴,王恒明,李植良,李颖. 2015

[14]木薯乙烯信号途径重要基因的生物信息学及表达分析. 任梦云,冯仁军,史后蕊,云天艳,张恒. 2014

[15]蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析. 黄启星,郭安平,杨礼富,邹智. 2012

[16]多重耐药胸膜肺炎放线杆菌GD2107株全基因组测序及生物信息学分析. 徐民生,柯海意,杨冬霞,施科达,孙泽仪,牛佳伟,常鑫,翟少伦,臧莹安,李春玲. 2022

[17]1型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR全长基因的扩增及生物信息学分析. 向蓉,岳磊,李林林,孙敏华,董嘉文,胡奇林,袁建丰. 2013

[18]剪接因子SQD在家蚕中的表达定位与功能分析. 蔡敏玲,张康,张纯,邓惠敏,朱子丹. 2023

[19]香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析. 黎维丽,余乃通,李俊成,王健华,李宾宾,刘志昕. 2019

[20]木薯MeHDS09基因克隆及其对逆境信号的响应. 王树昌,于晓玲,李淑霞,阮孟斌,彭明. 2017

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：广东省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台