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芹菜EST-SSR分析

文献类型： 中文期刊

作者： 褚云霞 1 ; 黄志城 1 ; 李寿国 2 ; 顾可飞 1 ; 陈海荣 1 ; 顾晓君 2 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所

2.农业部植物新品种DUS测试(上海)分中心

关键词： 芹菜;EST;SSR;亲缘关系

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2013 年 29 卷 02 期

页码： 24-28

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以NCBI公布的EST数据为基础,通过一系列软件处理,连接成长175.294 kb的无冗余EST序列324条,从23条序列中发现25个SSR,每7.011 kb出现1个SSR位点。运用Primer 3设计出引物15对,结合文献公布的11对引物,以46份中国芹菜品种及7份西芹品种的总DNA为材料,对EST-SSR在芹菜上的应用可行性进行验证,53份芹菜品种的12个微卫星位点共检测到32个等位基因,等位基因2(引物4)~4个(引物11),平均等位基因数为2.7个;并对53份材料的亲缘关系进行了鉴定。

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