文献类型： 中文期刊

作者： 谢元澄 ¹ ; 李欣原 ¹ ; 苏胜彦 ¹ ; 梁敬东 ¹ ; 徐跑 ¹ ; 贺鑫晋 ¹ ; Bouzoualegh Raouf ¹ ;

作者机构： 1.南京农业大学无锡渔业学院;南京农业大学信息科学技术学院;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室;山西农业大学动物科技学院

关键词： 黄河鲤;品系选育;IGF2b;分段克隆;SNPs;分子育种

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2019 年 04 期

页码： 686-694

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了建立鲤IGF2b (insulin-like growth factor 2)基因全基因组信息SNPs (single nucleotide polymorphism)的获取体系,并验证该获取体系在黄河鲤新品系选育中运用的适用性,本研究首先对10个不同鲤品种的33个鲤个体重测序数据进行分析,整体上了解IGF2b基因的单核苷酸位点及其在基因组上的分布情况。然后在基因组DNA水平上分段获取IGF2b基因的SNPs信息,并以不同的鲤品种验证引物的适用性,最后在黄河鲤新品系中检测其应用。研究结果:获得8对聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)引物进行分段克隆的结果,并通过直接测序和限制性片段长度多态性来获取相应的SNPs。经过直接测序,本文对黄河鲤、建鲤、黄河鲤和建鲤的正反交后代进行PCR检测发现条带单一,目地片段正确;结合黄河鲤新品系的体重数据,本文又以IGF2b~(3#)引物检测到一个与体重明显相关的SNPs,同时检测到一个与该基因表达量相关的另一个SNPs。本研究的方法能够在该基因全基因组范围内开展鲤分子育种中SNPs的检测,并验证发现黄河鲤新品系IGF2b~(3#)引物227号位点处,出现的突变位点使体重降低,且有一处SNPs与其表达量有关。这将为其他物种、其他功能基因的多态性分子标记研究提供思路。