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油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因的鉴定与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 肖勇 1 ; 雷新涛 1 ; 王永 1 ; 曹红星 1 ; 石鹏 1 ; 金龙飞 1 ; 夏薇 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院椰子研究所

关键词: 油棕;ACC基因;转录组;RPKM

期刊名称: 安徽农业科学

ISSN: 0517-6611

年卷期: 2017 年 31 期

页码: 154-155+159

摘要: [目的]对油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因进行鉴定与表达分析。[方法]采用生物信息学方法鉴定油棕的ACC基因,并应用拟南芥的ACC基因蛋白质序列比对油棕的蛋白质库,应用已有油棕转录组信息,研究ACC基因在不同组织中的表达情况。[结果]在油棕中鉴定了2个ACC基因,命名为EgACC1和EgACC2。EgACC1不含内含子,而EgACC2含有32个内含子;EgACC1在不同组织中都没有表达,而EgACC2在所有组织中都有表达,其中在组培苗中有较高的表达量,同时,在油棕果发育21 d时有高的表达水平,RPKM值为70.6,为所有组织中最高。[结论]该研究阐述了油棕ACC基因的表达模式,为油棕ACC基因的功能分析奠定了基础。

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