文献类型： 中文期刊
作者： 刘寒苗 1 ; 吴彪 1 ; 刘志鸿 1 ; 杨爱国 1 ; 周丽青 1 ; 孙秀俊 1 ;
作者机构： 1.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院
关键词： 魁蚶;COⅠ基因;12S rRNA基因;18S rRNA基因;28S rRNA基因;遗传多样性
期刊名称： 渔业科学进展
ISSN： 2095-9869
年卷期： 2017 年 06 期
页码： 92-99
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 采用PCR技术扩增了中国山东胶南、长岛、蓬莱、荣成和韩国统营5个地理群体魁蚶(Scapharca broughtonii)样本的COⅠ、12S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因部分序列,分析了魁蚶5个地理群体的遗传多样性和系统进化关系。经测序拼接、剪接后,分别获得67条776 bp的COⅠ序列、72条443 bp的12S rRNA序列、75条909 bp的18S rRNA序列和75条894 bp的28S rRNA序列。序列分析结果显示,5个群体75个个体的COⅠ序列中共检测到466个多态位点,32种单倍型,单倍型多样性指数为0.925,核苷酸多样性指数为0.086;12S rRNA序列中共检测到292个多态位点,43种单倍型,单倍型多样性指数是0.928,而核苷酸多样性为0.0856;在18S rRNA序列中,5个群体都表现出丰富的遗传多样性,共有74种单倍型,909个多态位点,单倍型多样性指数为1.0,核苷酸多样性指数为0.717,其中胶南群体变异位点最多、多样性最丰富;通过对28S rRNA部分序列的分析发现,75个个体共检测到27个多态位点,18种单倍型,单倍型多样性指数为0.778,核苷酸多样性指数为0.289,蓬莱群体多样性最丰富。遗传距离分析结果表明,韩国群体与其他4个群体的遗传距离较大;基于COⅠ序列的系统进化树显示有多个聚群。
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