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应用RACE技术扩增鸭A-FABP基因及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 田勇 1 ; 张聪聪 2 ; 张红艳 2 ; 李进军 1 ; 卢立志 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院畜牧兽医研究所

2.浙江省农业科学院畜牧兽医研究所南京农业大学动物科技学院动物繁殖研究室

关键词： A-FABP基因;RACE;cDNA;鸭

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2012 年 48 卷 21 期

页码： 17-21

收录情况： 北大核心

摘要： 为揭示鸭A-FABP基因的结构和功能,运用RACE方法克隆并鉴定了鸭A-FABP基因的全长cDNA序列。用1对含高度保守的DNA片段的兼并引物,从鸭腹部脂肪组织总RNA扩增部分A-FABP片段,测序结果与已知序列一致;根据已知的鸭A-FABP基因序列设计新引物分别从5′和3′RACE扩增延长该片段。经DNASTAR中的SeqMan软件拼接5′RACE产物和3′RACE产物以及已知序列而获得片段大小为652 bp的cDNA序列。该cDNA序列由64 bp的5′非编码区、399 bp的编码序列和189 bp的3′非编码区组成。鸭A-FABP基因399 bp的开放阅读框编码132个氨基酸。经Blastn和Blastx比对分析,鸭A-FABP基因的编码区核苷酸序列与人、猪、鸡和鹅分别有76%、78%、93%和93%的同源性。

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