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二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND-5/6基因多态性的PCR-RFLP分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郑鹏飞 1 ; 张桂蓉 2 ; 魏开建 1 ; 邹桂伟 3 ; 王卫民 2 ;

作者机构: 1.华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室中国水产科学研究院长江水产研究所/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室

2.华中农业大学水产学院

3.中国水产科学研究院长江水产研究所

关键词: 泥鳅;二倍体;四倍体;RFLP;mtDNA;ND-5/6

期刊名称: 水生态学杂志

ISSN: 1674-3075

年卷期: 2011 年 32 卷 01 期

页码: 51-56

收录情况: 北大核心

摘要: 采用PCR-RFLP分析方法,对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNAND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明,120尾泥鳅mtDNAND-5/6扩增片段长度均为2.2kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切酶(HaeⅢ、DraⅠ、RsaⅠ、TaqⅠ、HinfⅠ、MspⅠ),对扩增产物进行酶切,共检测到66种单倍型。泥鳅群体内单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.7679~0.9385和0.01041~0.03212;其中,洞庭湖二倍体核苷酸多样性最高(0.03212),武汉二倍体其次(0.02452),二倍体群体内核苷酸多样性高于四倍体。群体间的核苷酸多样性(π)大小为0.02588~0.04144,平均值为(0.031737±0.000005)。群体间的核苷酸歧化距离(δ)大小为0.00462~0.01617,平均值为(0.010659±0.000003);其中,武汉二倍体和四倍体之间的核苷酸歧化距离最大(0.01617),武汉四倍体和洞庭湖二倍体之间的核苷酸歧化距离最小(0.00462)。MonteCarlo模拟x2检验表明,4个群体间的单倍型频率存在极显著差异(P<0.0001)。UPGMA聚类分析表明,武汉四倍体、洞庭湖二倍体和四倍体聚为一支,亲缘关系较近;武汉二倍体为单独一支。

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