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基于脂肪酸生物标记与16S rRNA的芽胞杆菌系统发育分析比较

文献类型: 中文期刊

作者: 刘国红 1 ; 刘波 1 ; 林营志 1 ; 唐建阳 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院农业生物资源研究所

关键词: 芽胞杆菌;脂肪酸生物标记;16S rRNA;系统发育分析

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2015 年 31 卷 03 期

页码: 146-153

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 旨在探究脂肪酸作为一种有效的芽胞杆菌分类标记,以25种芽胞杆菌模式菌株为研究对象,对芽胞杆菌进行脂肪酸组分和16S rRNA基因系统进化分析比较。结果表明,脂肪酸系统发育分析能充分体现芽胞杆菌种类间的亲缘关系,并且按生物学特性进行聚类分群,而16S rRNA系统发育仅完美体现出种间的亲缘关系。利用脂肪酸分析可将25种芽胞杆菌完全准确分开,且将生物学特性相同的芽胞杆菌种类聚为一类,如碱性条件下生长良好的4种芽胞杆菌(B.agaradhaerens、B.alacalphilus、B.alkalitelluris和B.fastidiosus)聚为一类,芽胞杆菌为圆形的芽胞杆菌(B.fusiformis、B.odysseyi和B.sphaericus)聚为一类。结果表明,脂肪酸分析不仅根据亲缘关系进行聚类,还可以根据生物学特性对芽胞杆菌进行分类。

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