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海南仙人掌matK基因的克隆和序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴育鹏 1 ; 余乃通 1 ; 周启林 2 ; 王健华 1 ; 刘志昕 3 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

2.文昌市农产品质量安全检验检测站中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室

3.中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室

关键词: 仙人掌;matK基因;克隆;序列分析

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2016 年 35 卷 11 期

页码: 3135-3140

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 2015年12月,为了分析采自海南海口城西仙人掌mat K基因的序列及同源关系,利用RNA plant Reagent试剂盒提取仙人掌叶总RNA,反转录成第一链c DNA。同时设计仙人掌成熟酶K基因(mat K)的1对保守引物,利用RT-PCR的方法扩增仙人掌成熟酶K基因,所得序列经Blastn进行比对,发现与已报道的22个仙人掌mat K基因核苷酸序列一致;利用Blastn的Distance tree of results构建系统进化树,结果显示海南仙人掌mat K基因与其它报道的30个仙人掌mat K基因同源性最高,同源性在99%以上,属于同一组,而与Opuntia basilaris(Gen Bank accession No.JF786750.1)同源性最低,为96.6%。本研究利用RT-PCR方法获得了仙人掌成熟酶K基因序列,同时构建的系统进化树确定了该仙人掌成熟酶K基因的同源关系。本结果将为海南仙人掌的进化研究提供科学线索。

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