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马铃薯StSTOP1基因的克隆、亚细胞定位及基因家族成员鉴定

文献类型: 中文期刊

作者: 黄美菁 1 ; 吕春娜 1 ; 康嘉慧 1 ; 周一帆 1 ; 赵酏浛 1 ; 王芳 2 ;

作者机构: 1.青海省农林科学院

2.青海大学农林科学院

关键词: 马铃薯;StSTOP1基因;生物信息学分析;亚细胞定位

期刊名称: 种子

ISSN: 1001-4705

年卷期: 2025 年 44 卷 003 期

页码: 1-9,16

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了探究StSTOP基因家族成员在马铃薯中的作用,对其进行生物信息学分析以及亚细胞定位检测。结果显示,筛选到的36个StSTOP基因家族成员在11条染色体上均有分布,蛋白长度在143~736个氨基酸之间,蛋白质分子量为16 451.97~75 366.80 Da,等电点为5.75~9.47,亚细胞定位预测大部分位于细胞核中。系统进化树分析显示,StSTOP和Ca.STOP1亲缘关系最近。顺式启动子作用元件预测分析表明,含有大量与环境、激素和生长发育等相关的顺式作用元件。共线性分析表明,不同物种中的StSTOP基因存在一定同源性。亚细胞定位结果显示,StSTOP1基因定位在细胞核。

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