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猪SRPK1基因的电子克隆

文献类型: 中文期刊

作者: 俄广鑫 1 ; 刘娣 1 ; 谢雨彤 1 ; 祝继原 1 ; 杨少成 1 ; 王嘉博 1 ; 赵金凤 1 ;

作者机构: 1.东北农业大学动物科学技术学院

关键词: SRPK1;生物信息学;电子克隆;开放读码框查找

期刊名称: 东北农业大学学报

ISSN: 1005-9369

年卷期: 2010 年 41 卷 03 期

页码: 101-104

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 用小鼠和人的SRPK1基因的编码区序列通过NCBI数据库进行比较和检索,得到一个高同源性的猪cDNA序列和4个猪SRPK1基因的ESTs。利用DNAMAN软件将以上片段进行拼接,得到了一条较长的拼接片段X-1。ORF finder和Blast 2 sequence程序分析。结果表明,X-1中包含一个完整的长为1 968 bp的编码区,编码656个氨基酸,且此编码区DNA序列与人的SRPK1基因有91.73%的一致性,氨基酸序列的一致性为92.93%。

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