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华重楼灰霉病菌灰葡萄孢ITS分型及SSR遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王帆帆 1 ; 唐涛 1 ; 曾佳 2 ; 郭杰 1 ; 唐其 3 ; 郭晓亮 1 ; 段媛媛 1 ; 游景茂 1 ;

作者机构: 1.湖北省农业科学院中药材研究所

2.华中科技大学同济医学院附属协和医院

3.湖南农业大学

关键词: 灰葡萄孢;rDNA-ITS;SSR-PCR;遗传结构;聚类分析

期刊名称: 菌物学报

ISSN:

年卷期: 2021 年 003 期

页码: 566-579

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 华重楼灰霉病在湖北和湖南两省多有发生,已对华重楼药材生产构成了严重威胁。为明确该病菌的遗传多样性水平,本研究对分离自两省10个地区的92株华重楼灰霉病菌进行了rDNA-ITS分子鉴定,同时采用SSR-PCR技术进行了遗传多样性分析。rDNA-ITS分子鉴定结果表明92株病原菌均为灰葡萄孢Botrytis cinerea,ITS系统发育树可初步显示其遗传多样性丰富。SSR-PCR多样性分析结果表明,应用9对SSR引物共检测出109个等位基因位点,等位基因和有效等位基因平均值分别为12和3.6589,香农指数和多态信息含量平均值分别为1.5048和0.6196。10个群体各自有效等位基因在1.622-3.971之间;香农指数在0.527-1.582之间;观测杂合度在0.148-0.593之间;期望杂合度在0.321-0.708之间。Nei遗传距离为0.15时,UPGMA聚类树可将92株病菌划分为4个类群。群体间基因流值为0.19-4.67,遗传分化值为0.047-0.638,群体遗传同一性和遗传距离范围值分别为0.1531-0.9679和0.0327-1.8766。综上所述,湖北和湖南两省华重楼灰霉病菌群体存在明显的遗传多样性,这为湖北和湖南两省区华重楼灰霉病的科学防治提供了理论依据。

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