文献类型： 中文期刊
作者： 段淋渊 1 ; 戴国礼 1 ; 焦恩宁 1 ; 秦垦 1 ;
作者机构： 1.宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所
关键词： 枸杞;密码子;偏好性;S-RNase;聚类分析
期刊名称： 西南林业大学学报(自然科学)
ISSN： 2095-1914
年卷期： 2020 年 02 期
页码： 44-52
收录情况： 北大核心
摘要： 为了掌握枸杞S-RNase密码子及其使用偏好性,利用EMBOSS和Codon W软件分析了枸杞S-RNase基因密码子的使用偏好性,并将其与酵母、大肠杆菌和柑橘等10种植物S-RNase基因密码子偏好性进行比对,结果表明:枸杞S-RNase密码子偏好以A/T结尾;RSCU值显示该基因高频率使用的密码子有9个,相较其他物种同源基因存在明显的密码子偏好性差异。此外,较密码子使用偏好性分析结果,基于S-RNase基因编码序列的聚类结果更能准确地反应物种之间的亲疏关系。比对其他物种该基因密码子的使用频率发现,同科物种差异较小,不同科物种差异较大;同时对比使用频率发现,枸杞S-RNase基因更适合导入酵母菌进行异源表达,但需要对其进行适当优化改造。
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