文献类型： 中文期刊
作者： 程运河 1 ; 程丽莉 1 ; 曹庆昌 1 ; 兰彦平 1 ;
作者机构： 1.北京市林业果树科学研究院
关键词： 板栗;STP家族基因;生物信息学;基因表达
期刊名称： 西南农业学报
ISSN： 1001-4829
年卷期： 2020 年 33 卷 010 期
页码： 2153-2161
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： [目的]糖转运蛋白基因STP(SUGAR TRANSPORT PROTEIN)是质外体单糖转运到细胞内的关键基因.糖分运输和分配对于板栗的花芽分化和果实品质形成具有重要意义.为了了解板栗中STP基因家族信息、功能和表达模式.[方法]使用HMM3.0软件,基于STP的隐马尔科夫模型,在板栗基因组数据库中,鉴定板栗CmS TP家族成员.利用TBtools、ExPASy、MEME等软件对CmSTP基因结构、编码蛋白理化性质、结构域和系统进化关系进行分析.并从板不同时期栗混合芽转录组数据中提取CmSTP的表达量,分析其表达模式.[结果]板栗基因组中共有17个STP家族成员,开放阅读框长度为843~ 1584 bp;编码蛋白分子量,介于32 122.5~57 788.3 Da,等电点介于5.46~ 10.46,均定位于细胞膜上,跨膜结构域大多为8~12个.CmSTP家族成员中共有10个保守motif,其中Motif1,Motif3和Motif5同时存在于17个CmSTP蛋白中,其余motif在N端或C端存在不同程度的缺失.根据进化关系,可将CmSTP分为4类,其中Group Ⅲ和Group Ⅳ中CmSTP成员较多,分别包含8和5个CmSTP蛋白.转录组数据分析表明,早春板栗树体萌动期,CmSTP6、CmSTP12和CmSTP15在混合芽的表达较高.CmSTP6在混合芽中的高表达持续时间较长.CmSTP家族成员的表达具有时空特异性.CmSTP6可能参与花芽春季早期发育的碳水化合物运输.[结论]本研究结果为进一步探究STP基因家族在参与植物生长发育过程中的分子机制奠定了基础.
- 相关文献
[1]板栗PPO基因克隆及生物信息学分析. 程丽莉,程运河,兰彦平,曹庆昌,胡广隆,苏淑钗. 2020
[2]辣椒WOX转录因子家族的鉴定、进化与表达分析. 张烨达,王星,王丽萍,佟静,武占会,高彦魁. 2023
[3]明清板栗古树指纹图谱的构建. 刘国彬,曹均,兰彦平,王金宝. 2017
[4]Y字形整形对板栗光合特性及生长结果的影响初报. 曹庆昌,王乐乐,曹均,兰彦平. 2018
[5]V字形树形对板栗光合特性及生长结果的影响试验初报. 曹庆昌,王乐乐,兰彦平,王金宝. 2017
[6]板栗新品种-怀丰. 兰彦平. 2012
[7]有机栽培条件下板栗桃蛀螟防治技术研究. 曹庆昌,曹均,张国珍,孙明德. 2010
[8]树形对板栗树光合特性日变化的影响. 曹庆昌,王乐乐,曹均. 2015
[9]板栗农家品种资源坚果表型性状分析. 刘国彬,兰彦平,兰卫宗,曹均. 2013
[10]板栗总苞与坚果表型多样性及其相关关系研究. 刘国彬,曹均,兰彦平,王金宝,刘建玲,兰卫宗. 2014
[11]北京密云水库库区板栗生产调查. 王瑞波,兰彦平,周连第,姚砚武. 2010
[12]板栗和锥栗远缘杂交亲和性研究. 刘国彬,兰彦平,曹均,兰卫宗,周连第,王金宝,刘建玲. 2013
[13]不同板栗品种营养品质的模糊综合评价研究. 周家华,常虹,熊融,兰彦平. 2013
[14]中国板栗种质资源的AFLP分析. 兰彦平,周连第,姚研武,王尚德,刘国彬. 2010
[15]板栗野生居群与栽培品种间叶绿体微卫星遗传差异初探. 黄武刚,程丽莉,周志军,刘建立. 2009
[16]北京山区板栗产业循环农业模式经济效益分析. 兰彦平,王瑞波,周连第,姚砚武. 2010
[17]板栗新品种‘黑山寨7号’. 黄武刚,周志军,程丽莉,陈生凡,何锡山. 2009
[18]板栗及其近缘种叶绿体SSR遗传多样性分析. 程丽莉,胡广隆,苏淑钗,黄武刚. 2015
[19]密云水库库区有机板栗栽培技术. 兰彦平,周家华,杨东升,田瑞冬,周连第,高天放. 2008
[20]板栗杂交后代坚果表型性状的遗传变异. 刘国彬,兰彦平,姚研武,兰卫宗,王金宝,刘建玲. 2011
作者其他论文 更多>>
-
北京市板栗产业发展问题及对策研究
作者：乔艳杰;刘巍;吴瑞刚;胡广隆;兰彦平;程丽莉;程运河;毛威涛
关键词：板栗;产业;发展趋势
-
板栗花发育B类基因CmPI的克隆及功能分析
作者：郭晓萌;杨前宇;程丽莉;胡广隆;刘钊;周广柱;兰彦平;程运河
关键词：板栗;花器官;B类基因;基因功能验证;PISTILLATA
-
板栗果实酚类物质及其抗氧化活性研究
作者：李小艳;段鹏慧;张兴亮;兰彦平
关键词：板栗;酚类;抗氧化力;主成分
-
板栗CmFT基因的克隆及功能分析
作者：程运河;程丽莉;胡广隆;杨前宇;韩笑;兰彦平
关键词：板栗;CmFT;基因克隆;开花调控
-
山西省岚县沙棘资源现状调查分析
作者：张巧仙;兰彦平;张煜梓;张燕青;郭茂林
关键词：沙棘;单果重;可溶性固形物
-
板栗PPO基因克隆及生物信息学分析
作者：程丽莉;程运河;兰彦平;曹庆昌;胡广隆;苏淑钗
关键词：板栗;果实;PPO基因;生物信息学;表达分析
-
Y字形整形对板栗光合特性及生长结果的影响初报
作者：曹庆昌;王乐乐;曹均;兰彦平
关键词：板栗;‘燕山红栗’;Y字形;光合特性;生长结果
