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基于RNA-seq的谷子萌芽期抗旱相关基因挖掘与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 代小冬 1 ; 朱灿灿 1 ; 宋迎辉 1 ; 王春义 1 ; 代书桃 1 ; 秦娜 1 ; 李君霞 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院粮食作物研究所

关键词: 谷子;萌芽期;抗旱性;RNA-seq

期刊名称: 核农学报

ISSN:

年卷期: 2021 年 008 期

页码: 1761-1770

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了明确响应干旱胁迫的关键基因,解析谷子抗旱机制,本研究以谷子抗旱品种山西2010和干旱敏感品种K359*M4-1为材料,应用RNA-seq技术对两个品种干旱胁迫前后萌发期种子进行转录组测定。结果表明,在山西2010和K359*M4-1中分别鉴定出2 300个和3 652个差异表达基因(DEG),包括编码类锌诱导的促进因子、类萌发素蛋白、蛋白磷酸化酶、转运蛋白、胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA)、转录因子、过氧化物酶等基因。通过对鉴定到的DEG进行GO和KEGG代谢途径富集分析,发现山西2010和K359*M4-1中的DEG分别富集在52个和21个生物学过程。KEGG富集分析发现,DEG主要富集在淀粉和蔗糖代谢,植物激素信号转导,光合作用-天线蛋白,苯丙素生物合成,角质、亚氨酸和蜡生物合成,次生代谢物生物合成等途径。本研究结果为挖掘谷子抗旱关键基因、解析谷子抗旱机制奠定了基础。

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