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大豆过氧化物酶Ⅲ的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 魏崃 1 ; 张丽 1 ; 王伟威 1 ; 于志远 1 ; 喻德跃 2 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院大豆研究所

2.南京农业大学大豆研究所国家大豆改良中心作物遗传与种质创新国家重点实验室

关键词： 过氧化物酶Ⅲ;系统进化分析;基因表达谱;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 11 期

页码： 2453-2460

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 过氧化物酶Ⅲ(ClassⅢPOD)普遍存在于植物体内一类多基因家族蛋白,它属于一类PR蛋白;广泛参与植物的多种生理生化过程,在维持植物体内过氧自由基和H2O2处于稳定水平方面发挥着重要作用。本文通过生物信息学的方法,共筛选获得164条大豆过氧化物酶Ⅲ序列。以本实验室克隆得到的Glyma02g40040.1为目的基因,对该基因及其同源蛋白的结构和功能进行了分析,并用Mega4.0软件构建其系统进化树;同时对Soy Base中的大豆过氧化物酶Ⅲ的表达数据进行分析。结果表明:Glyma02g40040.1编码324个氨基酸,等电点为9.51,不存在跨膜结构域属于外分泌蛋白;与Gm Prx50的相似性达到93.85%,二级结构以σ螺旋为主,主要在花中和根中表达;大豆Gm Prxs基因具有明显的组织特异性表达模式。上述分析为进一步阐明过氧化物酶Ⅲ基因家族在植物生长发育过程中功能及分子机制奠定重要基础。

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