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玉米FBA基因家族成员鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 苏在兴 1 ; 黄忠勤 1 ; 谢昊 1 ; 李小珊 1 ; 高闰飞 1 ;

作者机构： 1.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所

关键词： 玉米;果糖-1,6-二磷酸醛缩酶;FBA基因家族;生物信息学;表达分析

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2024 年 32 卷 007 期

页码： 29-39

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解玉米ZmFBAs家族成员的基本信息,以8个拟南芥AtFBAs家族成员蛋白序列为基础,通过本地Blastp对玉米全基因组进行同源序列比对,并对获得的ZmFBAs进行系统的生物信息学和表达谱分析.结果表明,鉴定到7个玉米ZmFBAs基因家族成员,含TIM superfamily和PLN02425两种典型保守结构域.根据进化关系和保守结构域,ZmFBAs可分为两个亚家族,分别对应亚细胞定位预测的质体和胞质,ZmFBAs启动子区富含光响应、激素响应、逆境响应等顺式作用元件.玉米ZmFBAs分布在5条染色体上,其中两对基因发生了片段复制事件.ZmF-Bas在不同组织中呈现多种表达模式,具有组织表达特异性,ZmFBA4、ZmFBA6和ZmFBA7在所有组织中均表达,ZmFBA3为不表达基因.ZmFBAs在响应生物和非生物胁迫时呈现出不同的表达模式.

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