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西瓜FBA基因的鉴定及其对不同逆境的响应模式分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李丽莉 1 ; 姚依秀 1 ; 何艳军 2 ; 孙玉燕 2 ; 郭平安 2 ; 范敏 2 ; 高杰 1 ;

作者机构: 1.新疆农业大学林学与园艺学院

2.浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词: 西瓜;果糖1,6-二磷酸醛缩酶(FBA);进化;表达;逆境

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2021 年 001 期

页码: 1-12

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 果糖1,6-二磷酸醛缩酶(FBA)是植物体内的一种参与糖酵解、糖异生和卡尔文循环的关键酶。FBA基因已被证实在植物生长发育及多种生物和非生物胁迫响应过程中发挥重要的作用,但目前对西瓜中FBA基因的研究却几乎空白。本研究采用生物信息学手段在西瓜基因组中共鉴定到5个Cl FBA基因,并对它们的保守结构域、基因结构、染色体位置、进化关系、亚细胞定位、基因复制事件、启动子顺式作用元件等进行预测和分析。根据进化和亚细胞定位分析,西瓜FBA蛋白主要分为两类,分别主要定位在叶绿体和细胞质中。此外,我们还利用荧光定量PCR对Cl FBA基因的时空表达模式进行分析,发现大部分西瓜Cl FBA基因在茎和果实中优势表达。同时对西瓜Cl FBA基因在不同生物和非生物逆境处理后的响应模式进行分析,鉴定到一批不同胁迫响应的Cl FBA基因,为西瓜的抗病和抗逆育种提供了重要的分子基础。

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