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太岁表层组织DNA提取前处理对细菌结构的影响

文献类型： 中文期刊

作者： 王朝江 1 ; 李慧 1 ; 王世清 1 ; 高春燕 1 ; 李聪 1 ;

作者机构： 1.河北省农林科学院遗传生理研究所

关键词： 太岁;表层组织;DNA提取前处理;细菌菌群结构

期刊名称： 生物技术

ISSN： 1004-311X

年卷期： 2019 年 005 期

页码： 463-469

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]比较不同DNA提取前处理方法对太岁表层组织细菌结构的影响.[方法]设水浸提(SO1)、浸提后热溶解(SO2)、直接热溶解(SO3)与微孔过滤结合的3种处理法,高通量测序.[结果]SO1、SO2、SO3的Shannon指数均接近4. 44,OTU数目均接近1 677个,共有OTU 807个,序列占比95. 65%.所含细菌在各分类水平上数目相近,各涉及约20个门、200多个属,优势类群集中在未分类属(unclassified)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)和Povalibacter 4个属,占比之和超过了60%.除未分类属外的三个属,均各有一种超高占比OTU支撑.假单菌属占比最高,各处理均为21%左右.[结论]3种前处理方法测得的细菌菌群结构,均表明太岁表层组织中细菌种类多,分布不平衡,假单胞菌属是占比21%的最优势属.

  • 相关文献

[1]DNA提取前处理方法对太岁里层样品中细菌种群结构的影响. 王朝江,高春燕,王世清,李慧,李聪. 2019

[2]基于高通量测序技术对三种太岁样品细菌组成的分析. 王朝江,王世清. 2017

[3]三种不同形态太岁所含古菌的结构研究. 王朝江,王世清. 2017

[4]太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响. 王朝江,王世清,高春燕,李慧,李聪. 2021

[5]太岁中真菌菌群结构及分离菌株的DNA验证. 王朝江,王世清,高春燕,李慧,夏伟伟. 2021

[6]16S rDNA克隆文库方法分析太岁样品中细菌的多样性. 王朝江. 2017

[7]影响细菌种群(太岁组织)结构关键因素的研究. 王朝江,李慧,王世清,高春燕,李聪,张洋,刘方. 2022

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