文献类型： 中文期刊
作者： 王朝江 1 ; 李慧 1 ; 王世清 1 ; 高春燕 1 ; 李聪 1 ; 张洋 2 ; 刘方 2 ;
作者机构： 1.河北省农林科学院经济作物研究所
2.南开大学生命科学学院
关键词： 太岁;细菌;组织前处理;DNA提取;菌群结构
期刊名称： 南开大学学报(自然科学版)
ISSN： 0465-7942
年卷期： 2022 年 55 卷 003 期
页码： 73-80
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 探索了太岁取样部位和DNA提取前处理2个因素对细菌菌群结构的影响,并获知真实的优势菌群信息.对表里部位重复取样样品,施加水浸提、热溶解与微孔过滤组合成的3种前处理,提取的DNA用Miseq平台测序,挖掘出共有、占比高、有最高丰度OTU支撑的菌群.发现太岁中细菌种类丰富,大部分是杂菌,由表至内,多数类群不明原因消失,多样性和丰度降低,假单胞菌属(Pseudomonas)丰度显著升高;其与不动杆菌属(Acinetobacter)、根瘤菌属(Rhizobium)和鞘脂菌属(Sphingobium)为共有优势属;3种前处理方法获得的菌群结构近似,以内部组织直接热溶解过膜法为最优,其假单胞菌属占比达48.32%.
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