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基于热溶解膜过滤法的太岁古菌菌群结构研究

文献类型： 中文期刊

作者： 王朝江 1 ; 王世清 1 ; 李慧 1 ; 信艳杰 1 ; 高春燕 1 ;

作者机构： 1.河北省农林科学院遗传生理研究所

关键词： 太岁;热溶解膜过滤法;古菌结构;甲烷杆菌属

期刊名称： 生命科学研究

ISSN： 1007-7847

年卷期： 2021 年 25 卷 004 期

页码： 355-362

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为获知太岁中古菌准确的菌群结构及分析其与原有结果的不同,在太岁组织表里层不同位置重复取样,采用适合太岁材料特性的热溶解膜过滤法处理后提取DNA,随后利用Illumina MiSeq高通量测序平台测定古菌16SrDNA V3~V4区扩增序列.结果显示:供试太岁所含古菌分属16个门、27个纲、39个目、64个属,相对丰度大于0.01%的属有22个;表层的多样性高于里层,由外至内有物种消失现象;重复取样间存在大量非共有菌群;甲烷杆菌属(Methanobacterium)是有高丰度OTU支撑的优势菌群,相对丰度在43.859 5%~96.811 0%,是用常规方法提取DNA测知的优势属中,唯一仍保持优势地位的属,且在内部样品中的相对丰度较之前测定值分别提升39.554 2%和65.924 4%.上述结果表明,甲烷杆菌属是太岁所含古菌的优势菌群,在其形成中存在作用.

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