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乙型脑炎病毒感染猪睾丸细胞的miRNA表达谱差异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张元鹏 1 ; 杨占娜 2 ; 杨利 2 ; 李兰 2 ; 于晓明 2 ; 杜露平 2 ; 陈瑾 2 ; 侯立婷 2 ; 乔绪稳 2 ; 侯继波 2 ; 郑其升 2 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院动物免疫工程研究所/国家兽用生物制品工程技术研究中心

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关键词: 乙型脑炎病毒;猪睾丸细胞;miRNA;高通量测序

期刊名称: 南京农业大学学报

ISSN: 1000-2030

年卷期: 2019 年 004 期

页码: 734-739

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]本试验旨在分析乙型脑炎病毒(JEV)感染猪睾丸(ST)细胞和正常ST细胞miRNA差异表达谱,以探索miRNA在JEV感染过程中的作用及其调控机制.[方法]分别提取正常ST细胞和JEV感染8 h后的ST细胞总RNA,利用高通量测序技术检测分析ST细胞中的miRNA表达谱并进行差异分析.使用miRanda软件对表达差异显著miRNA的靶基因进行预测并对靶基因进行GO分析.选取6个显著性差异表达的miRNA通过RT-qPCR进行验证.[结果]与正常ST细胞相比,JEV感染后的ST细胞有112个差异表达miRNA,其中80个miRNA上调表达,32个miRNA下调表达.经RT-qPCR方法验证6个差异表达的miRNA结果与高通量测序结果一致.差异表达miRNA靶基因的生物学功能相对集中在细胞代谢、细胞黏附等生物过程.[结论]检测和分析JEV感染后猪睾丸细胞的miRNA表达谱,获得了大量的与JEV感染相关的miRNA表达谱数据,为揭示JEV感染生殖系统致病机制提供了有效的数据和理论基础.

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