文献类型： 中文期刊

作者： 李小义 ¹ ; 张效平 ¹ ; 赵凤 ¹ ; 孔杰 ¹ ; 赵飞 ¹ ; 周洲 ¹ ; 王艳艳 ¹ ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院水产研究所

关键词： 肠道微生物;鲟鱼;高通量;多样性

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2018 年 24 期

页码： 164-167

摘要： 从贵州省水产研究所惠水试验基地采集杂交鲟鱼、养殖水体及饲料等样品,对鲟鱼前肠、中肠及后肠肠道微生物、养殖水体及饲料等样品微生物DNA进行提取扩增,结合宏基因组学测序技术和生物信息学分析等手段,对鲟鱼肠道微生物多样性进行分析。结果表明,在门水平上,变形菌门(Proteobacteria)在前肠、中肠、后肠及水样等样品为主要优势菌群,丰度分别为75. 0%、57. 4%、66. 0%、50. 8%。饲料样品中蓝细菌(Cyanobacteria)丰度最高,为59. 5%。属水平分析,前肠样品组G6中,假单胞菌属(Pseudomonas)丰度最高,为23. 18%,其次为气单胞菌属(Aeromonas,7. 23%)、不动杆菌属(Acinetobacter,3. 73%)、黄杆菌属(Flavobacterium,2. 47%)、unidentified Marinilabiaceae(2. 43%)、Sedimenticola(2. 20%)。中肠样品组G7中,以unidentified Marinilabiaceae(4. 22%)、Sedimenticola(3. 13%)、地杆菌属(Geobacter,2. 60%)、假单胞菌属(Pseudomonas,2. 37%)、不动杆菌属(Acinetobacter,1. 74%)、气单胞菌属(Aeromonas,1. 40%)为主。后肠样品组G8中,主要包括气单胞菌属(Aeromonas,0. 52%)、假单胞菌属(Pseudomonas,0. 47%)、不动杆菌属(Acinetobacter,0. 13%)、Sedimenticola(0. 07%)、unidentified Marinilabiaceae(0. 06%)、unidentified Chloroplast(0. 03%)。前肠、中肠肠道微生物类型及丰度差异不大,后肠细菌和前、中肠内细菌差异明显。