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2022-2023年我国部分地区猪A群轮状病毒分子流行病学调查分析

文献类型: 中文期刊

作者: 谷拉强 1 ; 陶然 2 ; 程曦 2 ; 张雪寒 2 ; 周金柱 2 ; 王丹丹 2 ; 王建新 1 ; 李彬 1 ;

作者机构: 1.河北农业大学动物医学院

2.江苏省农业科学院兽医研究所

关键词: 猪A群轮状病毒;VP4基因;VP7基因;分子流行病学

期刊名称: 南方农业学报

ISSN: 2095-1191

年卷期: 2023 年 010 期

页码: 3083-3091

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】探究我国部分地区猪A群轮状病毒(RVA)的分子流行病学特征,明确当前的优势基因型,为RVA科学防控与疫苗研发提供理论依据。【方法】2022年1月—2023年3月收集江苏、江西、福建、山西和贵州5省36个规模化猪场送检的434份腹泻仔猪粪便样品,采用RT-PCR检测样品RVA阳性情况,对部分RVA阳性样品的VP7和VP4基因进行扩增及测序,与各型参考序列进行多序列比对,使用MegAlign进行核苷酸序列同源比对分析,并采用MEGA 7.0的邻接法构建系统发育进化树。【结果】RT-PCR检测结果显示,434份腹泻仔猪粪便样品中RVA阳性样品为196份,阳性检出率为45.16%。2022年与2023年初的阳性检出率分别为40.37%(132/327)和59.81%(64/107)。根据样品来源地区,RVA阳性检出率最高的是江苏(57.70%),其次是江西(55.71%),福建、贵州和山西的RVA阳性检出率分别是35.66%、30.00%和22.23%。共获得各地区12株RVA的VP4和VP7基因序列信息,遗传进化分析结果表明,G型中G9为优势基因型(占83.4%),G4和G5分别占8.3%;而P型中P7为优势基因型(占75.0%),其次为P13和P23,分别占16.7%和8.3%;12株RVA分属4种基因型组合,分别为G9P[7](占75.0%)、G5P[13](占8.3%)、G9P[13](占8.3%)和G4P[23](占8.3%)。【结论】我国部分省份猪场RVA阳性检出率持续升高,猪群中RVA基因型复杂多样,优势基因型组合为G9P[7]。因此,今后有必要对猪群中RVA的流行情况进行持续监测,结合基因型致病性制定预防措施并开发针对性疫苗。

  • 相关文献

[1]猪A群轮状病毒VP6单克隆抗体的制备和初步鉴定. 李科茫,周金柱,周俊明,牛贝贝,武琦,郭容利,张雪寒,朱雪蛟,李彬,粟硕. 2023

[2]三株犬细小病毒的分离鉴定及VP2基因序列分析. 陈延宗,钱晶,王晶宇,赵航,毕振威,夏兴霞,诸玉梅,芮荣,王永山. 2021

[3]江苏地区屠宰场大肠杆菌O157:H7的分子流行病学研究. 张碧成,夏学峰,张雪寒. 2022

[4]江苏省及周边地区猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)分子流行病学调查. 曹东阳,王小敏,钱爱东,何孔旺,茅爱华. 2016

[5]鸡IBV的分离鉴定及S1基因序列分析. 李银,叶焕春,魏雪涛,黄欣梅. 2012

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