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猪ISG20基因生物信息学分析及其抗PEDV感染的初步研究

文献类型: 中文期刊

作者: 王梦璐 1 ; 张志杰 2 ; 李之晗 2 ; 聂晶晶 2 ; 瞿云芝 2 ; 张春红 2 ; 刘志成 2 ; 沈海燕 2 ; 张建峰 2 ; 孙亚妮 3 ; 李玉谷 1 ;

作者机构: 1.华南农业大学兽医学院

2.广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室

3.西北农林科技大学动物医学院

关键词: 干扰素刺激基因20;生物信息学分析;真核表达;猪流行性腹泻病毒

期刊名称: 动物医学进展

ISSN: 1007-5038

年卷期: 2024 年 45 卷 010 期

页码: 7-14

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了研究猪干扰素刺激基因20(interferon-stimulated gene 20,ISG20)的序列信息及其表达情况,并探讨其对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)增殖的影响,以提取的猪小肠上皮细胞IPEC-J2总RNA为模板扩增猪ISG20基因的CDS区序列,并应用生物信息学进行分析,进而构建pcDNA3.1-3×Flag-ISG20重组质粒转染入IPEC-J2细胞鉴定表达情况。此外,在转染重组质粒的细胞中感染PEDV分析ISG20对PEDV增殖的影响。结果表明,猪ISG20基因CDS区的大小为516 bp,编码171个氨基酸,理论等电点(pI)为8.84;猪ISG20存在2个N-糖基化位点和23个磷酸化位点,主要定位于细胞骨架和细胞质中,以α-螺旋和无规则卷曲构成;构建的pcDNA3.1-3×Flag-ISG20重组质粒能够在IPEC-J2细胞中表达,蛋白大小约为19.6 ku,而且可以明显抑制PEDV的增殖;克隆了猪ISG20基因,并且在IPEC-J2细胞中重组质粒pcDNA3.1-3×Flag-ISG20能够表达且发挥抑制PEDV增殖的作用,研究结果为深入探讨PEDV与ISG20的相互作用,以及以此为靶点筛选抗PEDV生物制剂提供了思路。

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