您好，欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库！
中国热带农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

香蕉β-淀粉酶基因家族的系统进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 董晨 1 ; 李伟才 1 ; 魏永赞 1 ; 王弋 1 ; 郑雪文 1 ; 胡会刚 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所农业部热带果树生物学重点实验室

关键词： 香蕉;β-淀粉酶;基因家族;系统进化分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2016 年 37 卷 11 期

页码： 2176-2182

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： β-淀粉酶(beta-amylase,Bmy)是一类关键的淀粉水解酶,在香蕉果实成熟淀粉降解转化为可溶性糖的过程中发挥着重要的作用。为了全面了解Bmy基因在香蕉基因组中的特征,研究基于香蕉基因组数据,通过生物信息学的方法对香蕉Bmy基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、内含子和外显子结构和保守结构域进行初步的预测与分析,并构建系统发育树。结果表明:编码香蕉β-淀粉酶的基因有15个,根据在染色体的位置命名为Ma Bmy1~15,Ma Bmy基因家族编码的氨基酸范围在68~1 453 aa,编码的蛋白相对分子量介于7.8~162.6 ku之间,15个Ma Bmy蛋白中有10个偏酸性,5个偏碱性。不稳定指数分析发现6个Ma Bmy蛋白为稳定蛋白;疏水性分析表明,所有的Ma Bmy蛋白为亲水性蛋白;香蕉Ma Bmy家族内含子最少含有2个,最多的含有10个;进化分析表明,Ma Bmy家族分4个亚家族,且与水稻的亲缘关系较近。研究结果为深入探讨Ma Bmy基因的功能及调控香蕉果实成熟的应用奠定基础。

  • 相关文献

[1]香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓. 2019

[2]香蕉α-淀粉酶基因家族的系统进化分析. 董晨,贾利强,决登伟,赵秋芳,陈宏良,胡会刚. 2016

[3]香蕉SPS基因家族的系统进化分析. 陈妹,吴建阳,张秀梅,邓旭,涂行浩,胡会刚,杜丽清. 2021

[4]香蕉ACS基因家族的系统进化分析. 李伟才,张纯,魏永赞,王弋. 2017

[5]香蕉SUS家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 吴建阳,陈妹,罗剑斌,胡会刚,武爱龙,张秀梅. 2024

[6]香蕉NINV基因家族鉴定及分析. 吴建阳,陈妹,唐路平,胡会刚,武爱龙,张秀梅. 2024

[7]橡胶树β-淀粉酶基因HbBAM1的克隆与表达分析. 阳江华,龙翔宇,秦云霞,唐朝荣. 2018

[8]玉米蔗糖合成酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 陈曙,赵秋芳,陈宏良,金辉. 2019

[9]马尾藻属新变种——拟披针叶马尾藻潭门变种的形态鉴定及系统进化分析. 邹潇潇,刘鑫鑫,朱军,林勇,黄惠琴,鲍时翔. 2016

[10]玉米泛素结合酶基因家族分析及低氮胁迫下亚家族UBC2的表达分析. 陈曙,赵秋芳,陈宏良,金辉. 2020

[11]植物肉桂醇脱氢酶及其基因研究进展. 张鲁斌,谷会,弓德强,常金梅. 2011

[12]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019

[13]基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,李金枝,郑雪文,王弋,李伟才. 2022

[14]巴西橡胶树FKBP基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018

[15]荔枝漆酶(LAC)基因家族鉴定及表达分析. 李郑华,姜成东,王鹏,李芳,王树军,刘耀婷,李焕苓,王果,王家保. 2023

[16]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021

[17]植物UDP-葡萄糖焦磷酸化酶家族基因鉴定及序列进化分析. 白蓓蓓,陈业渊,盖江涛,叶秀旭,王鹏. 2019

[18]可可泛素结合酶基因家族的生物信息学初步分析. 赵秋芳,董晨,决登伟,陈宏良,贾利强. 2016

[19]基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析. 鹿志伟,侯晓婉,杨子平,张燕梅,李俊峰,周文钊. 2019

[20]茄科植物木糖转移酶家族基因挖掘与进化分析. 王鹏,李慧,简熠,吕勇志,盖江涛. 2018

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国热带农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台