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3′RACE法扩增谷氨酰胺合成酶基因及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张志灯 1 ; 罗土炎 2 ; 饶秋华 2 ; 曹治云 2 ; 郑腾 2 ;

作者机构： 1.福建出入境检验检疫局技术中心

2.福建出入境检验检疫局技术中心;福建农林大学动物科学学院;福建省农业科学院中心实验室;福建中医药大学中西医结合研究院

关键词： 谷氨酰胺合成酶基因;3′RACE;生物信息学

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2012 年 27 卷 09 期

页码： 11-15

摘要： 以抽提得到的黑曲霉mRNA为模板,根据GenBank上检索的谷氨酰胺合成酶基因mRNA序列,设计特异性引物,进行3′RACE PCR扩增,并在NCBI网站进行生物信息学分析。结果扩增得到长约1kb的DNA片段,测序结果表明,所获得的DNA序列与gene bank上检索到黑曲霉产谷氨酰胺合成酶基因的同源性大于97%,与其他曲霉产谷氨酰胺合成酶的基因同源性大于50%。经开放阅读框软件分析发现其具有2个外显子,其中1个外显子的氨基酸序列与黑曲霉产GS同源性为100%。

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