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木薯地毯草黄单胞菌转化子T-DNA插入模式分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张长正 1 ; 刘进平 1 ; 时涛 2 ; 李超萍 2 ; 陈奕鹏 2 ; 黄贵修 2 ;

作者机构： 1.海南大学农学院

2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

关键词： 木薯;细菌性枯萎病菌;T-DNA插入模式

期刊名称： 热带生物学报

ISSN： 1674-7054

年卷期： 2016 年 7 卷 02 期

页码： 246-252

摘要： 随机挑取30个已构建的木薯地毯草黄单胞菌(Xanthomonas axonopodis pv.manihotis)Tn5转化子,利用hi Tail-PCR技术获得Tn5转座子插入位点的侧翼序列64条。其中,有19个转化子获得了插入位点左右两端的侧翼序列,11个转化子获得了单侧侧翼序列。序列分析结果发现,插入位点集中在低GC含量区,特别是49%~50%的区域;Tn5转座子倾向于插入基因编码区内;Tn5转座子的插入会形成9 bp正向重复序列,且插入方向没有偏好性,9 bp正向重复序列的上下游碱基位点中,-5,-2,1,4,5,6,9,11位可能对转座酶的识别起关键作用。

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