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棉花EPSPS基因一个可变剪接体的克隆及功能分析

文献类型： 中文期刊

作者： 倪万潮 1 ; 郭书巧 1 ; 束红梅 1 ; 帕尔哈提·买买提 2 ; 何林池 3 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花和油菜重点实验室

2.国家棉花工程技术研究中心

3.江苏沿江地区农业科学研究所

关键词： 可变剪接;棉花;EPSPS基因;原核表达

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2016 年 28 卷 01 期

页码： 18-26

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 可变剪接是生物体基因在转录过程中存在的普遍现象,该现象是导致蛋白质功能多样性的重要原因之一,但是在棉花中关于功能基因可变剪接事件的报到相对较少。本文在克隆棉花EPSPS(5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate synthase)基因的过程中,发现了该基因的一条可变剪接序列。运用生物信息学的方法研究发现,该序列比正常的EPSPS基因的c DNA序列少152 bp,这造成了终止密码子在该序列的提前出现;正常的EPSPS基因内含子的剪切都遵循常见的"GT-AG"剪切规律,而该可变剪接序列最后一个内含子的剪切是按照"AT-AC"规则进行;该可变剪接序列预测的三维结构模型同正常的EPSPS基因的三维结构存在显著差异。将该可变剪接序列插入到原核表达载体p ET32a,随后将构建好的原核表达重组载体转化入大肠杆菌菌株BL21(DE3)Δaro A,通过在M9基本培养基中的生长研究发现该可变剪接序列不具备正常EPSPS基因所具有的功能。本研究结果丰富了棉花EPSPS基因转录本存在的形式,为深入研究棉花EPSPS基因的转录机制打下了基础。

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