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基于EST-SSR标记的甘薯种质资源DNA指纹图谱构建

文献类型: 中文期刊

作者: 罗忠霞 1 ; 房伯平 1 ; 李茹 1 ; 王章英 1 ; 黄立飞 1 ; 陈景益 1 ; 张雄坚 1 ; 李育军 1 ; 陈新亮 1 ; 黄实辉 1 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院作物研究所

关键词: 甘薯;种质资源;EST-SSR;DNA指纹图谱

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2014 年 15 卷 04 期

页码: 810-814

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用EST-SSR标记构建了国家种质广州甘薯圃中52份甘薯种质资源的DNA指纹图谱。利用52份供试资源,从早期筛选出的342对候选多态性引物中筛选出16对核心引物,16对引物在52份资源中共扩增出159个等位位点,每对引物的等位位点数为5~19个不等,平均为9.94个,多态性信息含量变化范围为0.6235~0.9593,平均为0.7991。选择带型清晰、重复性好、易于统计且能将52份资源完全区分开的2对引物组合构建供试资源的DNA指纹图谱。NTSYS软件聚类分析表明,EST-SSR标记能正确反映出不同资源间的亲缘关系,为构建甘薯大型DNA指纹图谱数据库奠定了基础。

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