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我国大蒜潜隐病毒的基因组结构及3’端序列的变异

文献类型： 中文期刊

作者： 陈炯 1 ; 陈剑平 2 ; 郑红英 3 ; 杨崇良 4 ;

作者机构： 1.浙江大学生命科学学院

2.浙江省农业科学院病毒室

3.华中农业大学植物保护系

4.山东省农业科学院植物保护研究所

关键词： 大蒜潜隐病毒;核苷酸序列;基因组结构;变异

期刊名称： 中国科学(C辑:生命科学)

ISSN： 1006-9259

年卷期： 2002 年 32 卷 03 期

页码： 225-231

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从我国6个省市12个大蒜样品上共检出10个不同的香石竹潜隐病毒属（Carlavirus）分离物,测定了浙江分离物ZJ1的基因组全序列和其他9个分离物的基因组3＇端序列.ZJ1分离物RNA基因组全长8363个核苷酸,3＇端具polyA尾,含6个可读框（ORF）,分别编码复制酶,TGB1,TGB2,TGB3,CP和NABP,基因组结构和其他Carlavirus属成员相似.序列分析表明,10个分离物均为大蒜潜隐病毒（GarLV）,不同分离物TGB2,TGB3和NABP的差异大于CP的差异,且这些分离物和葱潜隐病毒（ShLV）也具有很高的同源性.系统进化树分析表明,大蒜来源的GarLV分离物可以分成4个类群,我国分离物分别属于4个不同类群.

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