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小麦3B短臂染色体抗赤霉病主效QTL区域候选基因的表达

文献类型： 中文期刊

作者： 丁彬彬 1 ; 张旭 2 ; 吴磊 2 ; 王秀娥 1 ; 马鸿翔 2 ;

作者机构： 1.南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室

2.江苏省农业科学院江苏省农业生物学重点实验室/江苏省作物生产协同创新中心

关键词： 小麦;赤霉病抗性基因;半定量PCR;定量PCR;基因表达

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2017 年 33 卷 01 期

页码： 6-12

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过研究赤霉病菌接种后的基因表达,筛选小麦赤霉病抗性相关基因。根据前人研究结果,利用FGENESH软件对小麦3B短臂抗赤霉病主效QTL所在的小麦基因组测序获得的重叠群ctg0954核苷酸序列进行基因预测,共预测得到489个基因。以携带该QTL的苏麦3号和未携带该QTL的扬麦15为材料,在小麦花期进行赤霉病菌接种诱导基因表达,接种后0 h、4 h、8 h、12 h、24 h对其中有功能注释的259个预测基因的表达进行半定量分析,获得27个在品种间差异表达的基因。这27个基因的表达分为4类:一直上调表达(Ⅰ型),在接种后的早期上调表达后期下调表达(Ⅱ型),接种后早期下调表达后期上调表达(Ⅲ型),接种后一直下调表达(Ⅳ型)。在差异表达基因中,选择6个基因,进行Real-time PCR分析,结果表明这些基因在接种病原菌后均上调表达,且在苏麦3号和扬麦15号品种间存在基因表达差异,验证了半定量表达结果,可作为与赤霉病抗性相关3B短臂主效QTL的候选基因。

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