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线辣椒SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 李全辉 1 ; 李江 2 ; 邵登魁 2 ; 王亚艺 2 ; 侯全刚 2 ; 钟启文 3 ;

作者机构: 1.青海大学农林科学院

2.;青海大学农林科学院

3.;青海大学农林科学院;

关键词: 线辣椒;SSR;体系优化;引物筛选

期刊名称: 西北农业学报

ISSN: 1004-1389

年卷期: 2017 年 07 期

页码: 1047-1053

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以循化线辣椒果实黄色突变体H0809和高代自交系0599-1为试材,采用L_9(3~4)正交试验设计,研究线辣椒SSR-PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响,并对420对SSR分子标记进行筛选。结果表明,最优的反应体系为:总体积20μL,基因组DNA 20 ng,dNTP 100μmol·L~(-1),引物0.6μmol·L~(-1),Mg~(2+)2.5 mmol·L~(-1),Taq DNA聚合酶1.5μmol;通过筛选,获得72对具有多态性的SSR标记,多态性率为17.1%,平均每个标记扩增出2.67个等位基因。本试验建立的SSR-PCR反应体系和筛选的多态性标记可用于线辣椒种质资源分析、分子标记辅助育种、分子遗传图谱构建及基因克隆等研究。

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