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五个罗氏沼虾群体遗传多样性的微卫星分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李景芬 1 ; 夏正龙 2 ; 栾生 3 ; 蔡缪荧 2 ; 罗坤 3 ; 唐琼英 1 ; 高权新 1 ; 孔杰 3 ; 杨国梁 1 ;

作者机构: 1.湖州师范学院 浙江省水生生物资源养护与开发技术研究重点实验室

2.江苏数丰水产种业有限公司

3.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词: 罗氏沼虾;微卫星标记;遗传多样性;群体遗传结构

期刊名称: 水生生物学报

ISSN: 1000-3207

年卷期: 2020 年 44 卷 006 期

页码: 1208-1214

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用16对微卫星标记对来自泰国(CP)、缅甸(MN)、孟加拉(BD)和中国(MP和DP)的共5个罗氏沼虾群体进行了遗传多样性和遗传结构的分析.结果显示, 16个微卫星位点均具有较高的多态性, 平均等位基因数( N a)、期望杂合度( H e)、Shannon信息指数( I )和多态信息含量(PIC )分别为17.563、0.8316、2.1662和0.7328.5个群体的期望杂合度(H e)介于0.7025—0.8594,多态信息含量(PIC)介于0.6538—0.8048,表明所有群体均具有高度遗传多样性, 遗传多样性水平CP>MP>BD>MN>DP.遗传分化指数(Fst)值介于0.03430—0.17333, 表明所有群体间均有不同程度的遗传分化.16个微卫星位点的Fst值均大于0.05, 均值为0.0977, 与群体间有遗传分化相符.AMOVA分析显示群体间变异占总变异的6.22%, 群体内个体间的变异占总变异的40.72%, 个体内部的遗传变异占总变异的53.07%.基于Nei氏遗传距离构建的UPGMA系统进化树显示, MN群体首先与MP群体聚为一类, 再与DP群体聚为一类, 之后再与BD群体聚为一类, 最后与CP群体聚为一类, 表明中国群体与泰国群体亲缘关系较远.遗传结构分析显示, 参试样本被划分为5个理论群体, 除MP群体中个体遗传结构混杂外,其余群体中个体遗传结构相对独立.研究为罗氏沼虾种质资源的开发利用和优良品种的选育提供了参考数据.

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