文献类型： 中文期刊

作者： 王晶晶 ¹ ; 李旭鹏 ² ; 薛倩 ² ; 曹宝祥 ² ; 栾生 ² ; 罗坤 ² ; 隋娟 ² ; 代平 ² ; 曹家旺 ² ; 谭建 ² ; 陈宝龙 ² ; 傅强 ² ; 孔杰 ² ; 高焕 ¹ ; 孟宪红 ² ;

作者机构： 1.江苏海洋大学海洋科学与水产学院江苏省海洋生物资源与环境重点实验室/江苏省海洋生物技术重点实验室

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室

关键词： 凡纳滨对虾;白斑综合征病毒（WSSV）;TRAP;表达水平;SNP;DNA甲基化

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2024 年 001 期

页码： 1-13

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究旨在探讨凡纳滨对虾（Litopenaeusvannamei）易位子相关蛋白α亚基（translocon-associatedproteinalpha,TRAPα）基因特征及其在抗白斑综合征病毒（white spot syndrome, WSSV）中的作用。通过PCR和Sanger测序技术,获得凡纳滨对虾TRAPα的开放阅读框（openreadingframe,ORF）序列,将该基因命名为Lv-trapα,并进行生物信息学分析。采用real-time PCR分析Lv-trapα基因在健康凡纳滨对虾和感染WSSV不同时间点的凡纳滨对虾肝胰腺、鳃、肌肉、眼柄中的Lv-trapα表达水平。同时,利用重亚硫酸氢盐测序技术（bisulfite sequencing PCR, BSP）检测健康凡纳滨对虾和感染WSSV后96 h的凡纳滨对虾肝胰腺组织中Lv-trapα基因上游DNA序列的甲基化水平。结果显示,Lv-trapα的ORF全长873 bp,共编码290个氨基酸,预测相对分子质量为32466.4,理论等电点为4.45。多序列比对发现TRAPα蛋白的保守性较高。Lv-trapα DNA序列中有8个单核苷酸多态性位点（single nucleotide polymorphism,SNP）,其中1个SNP位点处于外显子区域且属于错义突变,其余7个SNP位点处于内含子区域。real-time PCR结果显示, Lv-trapα基因在凡纳滨对虾肝胰腺、鳃、肌肉、眼柄中均有表达,且在感染WSSV后显著上调表达（P＜0.05）。值得注意的是,在感染WSSV后96 h,体内病毒含量不同的凡纳滨对虾肝胰腺中Lv-trapα的表达水平差异显著,高病毒含量组中Lv-trapα的表达水平显著高于低病毒含量组（P＜0.05）,提示Lv-trapα表达水平和WSSV复制水平存在正相关性。BSP结果显示,Lv-trapα基因上游1个CpG位点（存在于NCBI数据库NW＿020872863.1第360336-360337 nt位置）的甲基化水平和Lv-trapα表达水平呈负相关,该CpG位点的甲基化水平和凡纳滨对虾体内WSSV病毒含量也呈负相关。本研究可为深入研究凡纳滨对虾抗WSSV的分子机制和抗病分子育种提供理论参考。