文献类型: 中文期刊
作者: 李献儒 1 ; 柳淑芳 2 ; 李达 2 ; 杜腾飞 2 ; 庄志猛 2 ;
作者机构: 1.大连海洋大学水产与生命学院
2.中国水产科学研究院黄海水产研究所
关键词: 鲱形目;COI基因;DNA条形码;遗传距离;系统进化
期刊名称: 中国水产科学
ISSN: 1005-8737
年卷期: 2015 年 22 卷 06 期
页码: 1133-1141
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用PCR特异性扩增获得中国近海鲱形目(Clupeiformes)2科6属7种的48条线粒体COI基因序列,结合从Gen Bank筛选出的4科40属83种的COI基因序列225条,对鲱形目鱼类的COI条形码基因特征、种内与种间遗传距离及其分子系统进化关系进行了分析,探索了DNA条形码技术在辅助鱼类物种鉴定和分类中的适应性。结果表明,4科41属90种273条COI基因序列的平均碱基组成为T:28.3%、C:28.3%、A:24.2%、G:19.2%,碱基组成表现出明显偏倚性。鲱形目鱼类种间的平均遗传距离为0.131,种内平均遗传距离为0.003,种间距离为种内距离的41倍;系统学分析结果显示,97.8%的鱼类在系统进化树上均为单系。可见,鲱形目鱼类DNA条形码符合物种鉴定的要求,且基于COI基因所建的NJ树对物种分类具有较为准确的辨识力。系统进化分析结果表明,COI基因不仅能够解决低阶分类单元的系统进化关系,对于高阶分类单元的系统分析研究结果也有一定参考价值。
- 相关文献
[1]中国近海习见头足类DNA条形码及其分子系统进化. 王鹤,林琳,柳淑芳,姜志强,庄志猛. 2011
[2]南极鱼亚目鱼类DNA条形码及分子系统学. 姜郦轩,张吉昌,樊钢洲,李昂,柳淑芳,庄志猛. 2021
[3]基于线粒体COI基因序列的5种鲤养殖品种遗传多样性研究. 单云晶,鲁翠云,李超,张明昭,顾颖,孙效文. 2013
[4]基于DNA条形码研究中国枪乌贼和鸢乌贼的食物种类组成. 刘梦娜,徐磊,王雪辉,刘玉,王淼娣,邱永松,朱江峰,何映霖,贝伟烈,杜飞雁. 2020
[5]线粒体COI基因条形码在鲿科鱼类物种鉴定中的应用. 梁宏伟,孟彦,罗相忠,李忠,邹桂伟. 2018
[6]DNA条形码技术在鲻科鱼类鉴定中的应用. 刘璐,孙典荣,李纯厚,韩志强,高天翔,宋娜. 2016
[7]中国绥芬河三块鱼不同群体的种属划分及起源. 常玉梅,程磊,孙博,苏宝锋,梁利群,王维坤. 2018
[8]七鳃鳗属3种类的亲缘关系分析. 常玉梅,黄晶,孙博,苏宝锋,梁利群. 2018
[9]脊尾白虾3个野生群体线粒体COI基因的遗传多样性及其系统发育分析. 马朋,刘萍,李健,李吉涛,陈萍. 2011
[10]南极鱼类DNA条形码及分子系统进化研究. 赵娜,马春艳,宋炜,冯春雷,王鲁民,张凤英,蒋科技,赵宪勇,马凌波. 2018
[11]利用DNA条形码COI基因分析我国重要贝类系统进化关系. 赵庆,吴彪,刘志鸿,刘寒苗,孙秀俊,周丽青,张高伟,杨爱国. 2018
[12]DNA条形码在鰤属鱼类物种鉴定和系统进化分析中的适用性. 王开杰,徐永江,柳学周,崔爱君,姜燕,王滨,方璐. 2022
[13]拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点筛选. 马群群,马洪雨,马凌波,马春艳,崔海玉. 2010
[14]基于线粒体COI基因的南海浮游介形类斜突浮萤(Proceroecia procera)单倍型与种群遗传结构研究. 徐磊,季莹莹,黎红,杜飞雁. 2019
[15]基于线粒体COI基因的毛蚶群体遗传多样性. 田吉腾,侯丫,刘志鸿,杨爱国,吴彪,周丽青,董春光. 2016
[16]Real-time PCR法检测水产品中异鳞蛇鲭、棘鳞蛇鲭源性成分. 信红梅,姚琳,陆键萍,曲梦,江艳华,李风铃,郭莹莹,王联珠. 2020
[17]中国东南沿海弹涂鱼科常见鱼类的遗传多样性和DNA条形码. 杨帆,何利军,雷光春,张爱兵. 2012
[18]鲫属鱼类DNA条码及种与亚种划分. 程磊,常玉梅,鲁翠云,曹顶臣,孙效文. 2012
[19]基于线粒体COI基因序列的金乌贼群体遗传学研究. 单斌斌,宋娜,刘淑德,涂忠,王晓梅,高天翔,韩志强,张秀梅. 2017
[20]基于线粒体COI基因的6个黄鳝群体遗传多样性. 梁宏伟,孟彦,罗相忠,李忠,邹桂伟. 2018
作者其他论文 更多>>
-
金乌贼全人工繁育与增养殖技术创新应用
作者:刘长琳;边力;薛月光;柳淑芳;陈四清;薛同明
关键词:
-
海洋生态系统健康评估:机遇、困难与挑战
作者:孙晓霞;冷疏影;张亮;庄志猛;沙忠利;魏皓;孙松
关键词:海洋生态系统;海洋观测;健康评估;健康指标
-
几种海洋硬骨鱼类快、慢肌的化学组分差异分析
作者:王焕;柳淑芳
关键词:海洋硬骨鱼类;快肌;慢肌;化学成分特征
-
三种马鲛鱼快速检测方法的建立及应用
作者:杨健琪;李昂;柳淑芳
关键词:聚合酶链式反应(PCR);马鲛鱼;快速检测;物种鉴定
-
叶灯鱼与异灯鱼两属鱼类的分类与仔稚鱼形态学比较
作者:柳淑芳;刘巧红;王焕;李昂;安长廷;万瑞景;庄志猛
关键词:日本叶灯鱼;道氏叶灯鱼;异灯鱼;分类;仔稚鱼;发育形态
-
黄带拟鲹qRT-PCR内参基因筛选及验证
作者:李杰锋;王焕;李步苏;曾祥辉;柳淑芳;庄志猛
关键词:黄带拟鲹;qRT-PCR;内参基因;稳定性
-
三种不同游泳习性鱼类骨骼肌的快、慢肌纤维组织学特性
作者:曾祥辉;王焕;李步苏;李杰锋;柳淑芳;庄志猛
关键词:骨骼肌;快、慢肌纤维;组织学特征;游泳习性




