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DNA条形码在鲱形目鱼类物种鉴定和系统进化分析中的应用

文献类型: 中文期刊

作者: 李献儒 1 ; 柳淑芳 2 ; 李达 2 ; 杜腾飞 2 ; 庄志猛 2 ;

作者机构: 1.大连海洋大学水产与生命学院

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词: 鲱形目;COI基因;DNA条形码;遗传距离;系统进化

期刊名称: 中国水产科学

ISSN: 1005-8737

年卷期: 2015 年 22 卷 06 期

页码: 1133-1141

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用PCR特异性扩增获得中国近海鲱形目(Clupeiformes)2科6属7种的48条线粒体COI基因序列,结合从Gen Bank筛选出的4科40属83种的COI基因序列225条,对鲱形目鱼类的COI条形码基因特征、种内与种间遗传距离及其分子系统进化关系进行了分析,探索了DNA条形码技术在辅助鱼类物种鉴定和分类中的适应性。结果表明,4科41属90种273条COI基因序列的平均碱基组成为T:28.3%、C:28.3%、A:24.2%、G:19.2%,碱基组成表现出明显偏倚性。鲱形目鱼类种间的平均遗传距离为0.131,种内平均遗传距离为0.003,种间距离为种内距离的41倍;系统学分析结果显示,97.8%的鱼类在系统进化树上均为单系。可见,鲱形目鱼类DNA条形码符合物种鉴定的要求,且基于COI基因所建的NJ树对物种分类具有较为准确的辨识力。系统进化分析结果表明,COI基因不仅能够解决低阶分类单元的系统进化关系,对于高阶分类单元的系统分析研究结果也有一定参考价值。

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