文献类型： 中文期刊

作者： 孙宇 ¹ ; 刘志鑫 ² ; 叶子 ¹ ; 高爱平 ³ ; 罗睿雄 ³ ; 蒲金基 ¹ ; 张贺 ¹ ;

作者机构： 1.海南大学植物保护学院/热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室

2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室

3.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词： 杧果;双B-box结构域锌指蛋白（DBB）基因家族;全基因组鉴定;表达分析

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2021 年 012 期

页码： 2267-2278

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： B-box蛋白是一类锌指结构转录因子,其功能具有普遍性和特异性。为了揭示双B-box结构域锌指蛋白（double B-box, DBB）基因家族在杧果（Mangifera indica）中的序列特征及其表达特性,本研究以杧果全基因组数据为基础,采用生物信息学的方法对杧果DBB基因家族成员进行序列分析,并通过qRT-PCR技术研究杧果胶孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides, Cg）和细菌性黑斑病菌（Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae, Xcm）侵染过程中杧果DBB基因家族成员的相对表达量。结果表明,从杧果基因组中鉴定了9个DBB基因家族成员,命名为MiDBB1～9,9个MiDBBs蛋白均为不稳定亲水酸性蛋白,主要定位于细胞核中,不仅三级结构类似,N端还具有相同位点的两个保守结构域（B-box1和Bbox2）。根据蛋白结构预测、系统发育关系、保守基序及多重序列比对分析推测,杧果DBB基因家族在进化上具有结构保守性,功能上具有相似性。杧果与拟南芥（Arabidopsis thaliana）、烟草（Nicotiana tabacum）、苹果（Malus domestica）、菠萝（Ananas comosus）和毛果杨（Populus trichocarpa）构建的系统发育树显示,杧果DBB与毛果杨DBB亲缘关系最近,其次是苹果。qRT-PCR结果显示,胶孢炭疽菌侵染过程中,MiDBB1～9的相对表达量在12～48 h内持续上调,细菌性黑斑病菌侵染过程中,MiDBB2和MiDBB3的相对表达量在12～72 h内持续上调,初步确定了杧果DBB基因表达受胶孢炭疽菌和细菌性黑斑病菌的诱导。本研究结果为后续研究杧果DBB基因家族成员的功能和作用机制提供参考。