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猪流行性腹泻病毒锁核酸探针荧光定量PCR检测方法的建立

文献类型: 中文期刊

作者: 李艳 1 ; 卞志标 1 ; 翟少伦 1 ; 李春玲 1 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室/农业农村部兽用药物与诊断技术广东科学观测实验站

关键词: 猪流行性腹泻病毒;M基因;LNA-TaqMan探针荧光定量PCR

期刊名称: 广东畜牧兽医科技

ISSN: 1005-8567

年卷期: 2024 年 002 期

页码: 30-36

摘要: 为建立一种快速、灵敏的猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)早期痕量检测方法,该研究以PEDV的M基因为靶基因,设计了特异性引物和锁核酸(Locked Nucleic Acid,LNA)-TaqMan探针,经过条件优化,建立了基于LNA-TaqMan探针的PEDV荧光定量PCR方法,并与常规TaqMan探针法进行了比对。结果显示,所建立的PEDV的LNA-TaqMan探针荧光定量PCR方法最低检测限为3.2拷贝/微升,较常规TaqMan探针法提高了10倍;与猪传染性胃肠炎病毒、猪轮状病毒和猪德尔塔冠状病毒等多种病原不存在交叉反应,特异性良好;批内和批间重复性结果的变异系数均小于1%,重复性较好。应用该方法对103份临床样品进行检测,结果显示,共检出PEDV阳性样品47份,阳性率45.63%,与常规TaqMan探针法检测结果的阳性符合率为90.38%。本研究建立的基于LNA-TaqMan探针的荧光定量PCR方法为PEDV的精准检测和流行病学调查提供了一种新的技术选择。

  • 相关文献

[1]非洲猪瘟病毒锁核酸探针荧光定量PCR检测方法的建立. 李艳,郭怡德,勾红潮,卞志标,孙铭飞,蔡汝健,宋帅,蒋智勇,楚品品,徐民生,杨东霞,李春玲. 2021

[2]NA-1株鹅源副粘病毒M、F和HN蛋白基因的真核表达. 马爱霞,袁洁,丁壮,宣华,宋子运,徐明. 2008

[3]PRRSV缺失变异毒株JL/07/SWM基因克隆与原核表达. 丁壮,彭龙,宣华,王贵平. 2009

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[5]猪流行性腹泻病毒在稳定表达猪ACE2基因的IPEC-J2细胞中的增殖研究. 沈海燕,康桦华,刘志成,张建峰,张春红. 2020

[6]华南地区猪流行性腹泻病毒的分子流行病学调查与分析. 王栓群,孙瑞芹,刘燕玲,夏平安,宋长绪. 2015

[7]2021年广东省猪流行性腹泻病毒分子监测和部分S基因序列分析. 陈胜男,胡柱祺,林金森,邵洋洋,钟汝情,张杰,谢莹,焦思思,欧阳慧敏,卢嘉贤,许伟锋,邹育根,张建峰,翟少伦. 2022

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