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木薯钙/CaM调控类受体激酶基因MeCRLK1的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李瑞梅 1 ; 袁帅 1 ; 耿梦婷 1 ; 姚远 1 ; 刘姣 1 ; 段瑞军 1 ; 符少萍 1 ; 胡新文 1 ; 郭建春 2 ;

作者机构: 1.;海南大学农学院;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室

2.;海南大学农学院;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;

关键词: 木薯钙;钙调素调控类受体激酶;基因克隆

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2017 年 04 期

页码: 1581-1587

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 木薯作为热带亚热带植物对低温非常敏感。为研究木薯对低温敏感的分子机制,我们从低温信号传导途径中的感知方面展开研究。植物类受体激酶作为信号传导途径中的信号接收器,在植物响应低温信号刺激过程中起重要作用。因此本研究利用RT-PCR从木薯栽培种SC8中克隆了一个钙/钙调素调控类受体激酶基因,命名为Me CRLK1(Gen Bank Accession No.KP256022)并进行了系统的生物信息学分析。研究结果表明该基因CDS区为1 296 bp,编码一个431 aa的蛋白。该蛋白的分子式为C_(2118)H_(3391)N_(605)O_(636)S_(18),分子量约为48.08 k D,理论等电点为8.11。该蛋白预测具有多个不同的磷酸化位点,3个Ca M结合位点,4个紊乱区和1个球蛋白区。蛋白结构分析表明该蛋白具有一个跨膜区,一个S_TKc结构域,N末端没有信号肽。预测此蛋白可能亚细胞定位于膜上。Me CRLK1和At CRLK1蛋白序列分析表明,它们的相似性为79.8%,序列一致性为77.6%。二者序列的差异主要位于C末端。该研究结果为进一步验证Me CRLK1基因的功能奠定了基础。

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